⑥ 裁剪齐平且检查无误后,选择“Data”>“Export Alignment”>“MEGA Format”,保存碱基对齐且前后裁齐的序列文件到“align_seq.meg”。提示“Input title of the data”,输入“align_seq”,点击“OK”继续。提示“Protein-coding nucleotide sequence data?(是否为
根据提示输入Title,然后会出现一个对话框询问是否是Protein-coding nucleotide sequence data, 根据情况选择Yes或No。最后出现一个对话框询问是否打开,选择Yes,如图: 。 5. 回到MEGA主窗口,在菜单栏中选择”Phylogeny”-“Bootstrap Test of Phylogeny” -“Neighbor-joining”,打开一个窗口,里面有很多参数可以设置,...
单击“OpenData”选项,会弹出如下菜单: 浏览文献,选择要分析旳数据打开,单击“打开”按钮,会弹出如下操作界面: 此程序操作界面,提供了三种选择数据选择:NucleotideSequences(核苷酸序列)、ProteinSequences(蛋白质序列)、PairwiseDistance(遗传距离矩阵)。根据输入数据旳类型,选择一种,点击“OK”即可。假如选择“Pairwise...
8、g-OK-(Protein-coding nucleotide sequence data?-No);Phylogeny-Neighbor-Joining(NJ)Distance Options-Models-Nucleotide: Kimura 2-parameter;d: Transitions+Transversions;Include Sites-Pairwise DeletionTest of Phylogeny-Bootstrap; Replications 1000; Random Seed 64238OK;开始计算得到结果;(4) Image-Copy ...
25、“confirm”小窗口中出现提问“protein-coding nucleotide sequence data?”,若为蛋白质编码序列则点击“yes”,若为非蛋白质编码序列则点击“no”按钮;在弹出来的“select genetic code”小窗口中选择“invertebrate mitochondial”,点击“ok”按钮,即出现“view sequence data”窗口(数据处理窗口);该窗口最小化后...
(添加所要比对的的序列)→Alignment→Align by ClustalW→出现的界面点击 OK→Data→Expert Alignment→MEGA Format(保存该文件并命名)→出现界面 Protein Coding Nucleotide Sequence Data→点击 NO→关闭该比对界面→出现界面 Open The Data File in MEGA→点击YES→出现一个新界面, 不用管它, 点击另一个界面菜单...
considering all protein coding genes that were not marked as positive and removing genes labeled as cancer-related or cancer candidates in NCG and KEGG (https://www.kegg.jp/kegg/kegg1.html), along with all genes from the OMIM database (https://omim.org/). In addition, genes predicted to...
单击“Open Data”选项,会弹出如下菜单: 浏览文件,选择要分析的数据打开,单击“打开”按钮,会弹出如下操作界面: 此程序操作界面,提供了三种选择数据选择:Nucleotide Sequences(核苷酸序列)、Protein Sequences(蛋白质序列)、Pairwise Distance(遗传距离矩阵)。根据输入数据的类型,选择一种,点击“OK”即可。如果选择“...
根据提示输入Title,然后会出现一个对话框询问是否是Protein-coding nucleotide sequence data, 根据情况选择Yes或No。最后出现一个对话框询问是否打开,选择Yes,如图:。 5. 回到MEGA主窗口,在菜单栏中选择”Phylogeny”-“Bootstrap Test of Phylogeny” -“Neighbor-joining”,打开一个窗口,里面有很多参数可以设置,如何...
→Open Data F5”,打开待分析序列的“ .meg”文件; 在弹出来的“ Input Data”小窗口中选择“ Data type ”,如“ Nucleotide Sequence”、“Protein Sequences”、“Pairwise Distance ”等,点击“ OK ”按钮;在弹出来的( popped up)“Confirm ” 小窗口中出现提问“ Protein-coding nucleotide sequence data?