这个结构域由58-64个氨基酸组成,其中包含两个高度保守的α-螺旋。 MADS盒结构域的功能主要是识别和结合DNA,从而调控基因的表达。每个MADS box蛋白都有一个特定的DNA结合位点,这个位点通常位于目标基因的启动子区域。通过这种方式,MADS box蛋白可以调控细胞的生长、分化和发育过程。
MADS-box转录因子具有高度保守的MADS结构域,由56-58个氨基酸组成。根据蛋白质结构,MADS-box转录因子可分为两类,即类型I和类型II。类型I蛋白仅含有MADS结构域,并可进一步分为三个亚类,即Mα、Mβ和Mγ。类型II基因包括动物和真菌中的肌球细胞增强因子2(MEF2)-类基因以及植物中的MIKC型基因;这些基因的产物包含M...
MADS-box通常有两个保守的结构域:MADS和K结构域(其在pfam数据库中的号分别为:PF00319 and PF01486),作者利用pfam号在小麦基因组中查找MADS-box家族基因,共鉴定出201个M-I-K-C家族成员。 进化树表明家族成员可分成15个亚类,构树时也添加了水稻和拟南芥当中的MADS-box家族基因(下图黑色基因)。 比较基因组分析...
MADS-box基因家族是一类广泛存在于真核生物中的转录因子,在植物花器官分化、开花时间调节、以及果实发育等方面起到重要的调控作用[9];其通常分为I型和II型,其中,II型有4个保守结构域:M-domain(MADS-domain)、I-domain(intervening domain)、K-domain(keratin-like domain)和C-domain(C-terminal domain)[10]。
MADS-box基因家族是一类广泛存在于真核生物中的转录因子,在植物花器官分化、开花时间调节、以及果实发育等方面起到重要的调控作用[9];其通常分为I型和II型,其中,II型有4个保守结构域:M-domain(MADS-domain)、I-domain(intervening domain)、K-domain(kerat...
Mα、Mβ、Mγ和MIKC*亚组基因具有两到四个保守基序,而大多数MIKCC-like基因含有更多基序,最多可达八个。通过SMART在线工具进行注释,基序1和基序3是MADS-box结构域,基序1编码了29个蛋白,在所有ZlMADS-box蛋白中均出现。 除了6个I型蛋白外,其他81个ZlMADS-box家族成员均含有基序3,而基序1紧邻基序3。基序2是...
它们的共同特点在于都包含一个高度保守的MADS-box结构域,这是基因功能的关键所在。这一结构域在不同生物体中发挥着相似的调控作用,体现了生命体在进化过程中对基因功能的保守性追求。在动物和真菌中,I型MADS-box基因的代表是ARG80/SRF-1like基因。这些基因在植物中则对应为M型MADS-box基因。而在...
摘要:通过生物信息学的方法,利用拟南芥、水稻的MADS-box基因对草莓MADS-box基因家族进行鉴定和分析,共得到83个草莓MADS-box候选基因,且MADS-box结构域高度保守。进化分析表明,FvMADS1-FvMADS33可被细分为10个亚组,分别为AG、AGL12、AGL6、AGL2、SE、SVP、FLC、AP3、SOC1、AGL17;FvMADS34-FvMADS83可被细分为...
MADS-box蛋白因含有高度保守的结构域,其生物学功能存在冗余性。基因功能冗余可能是水稻适应多变环境并维持遗传稳定性的关键。在面对环境压力或基因突变时,通过冗余基因维持关键生物学过程的正常进行,从而增强生存能力。此外,多个基因参与同一生物学过程,但可能在不同的...