2.3. 菊苣蒲MADS-box基因的基因结构和保守基序分析 为了揭示菊苣蒲MADS-box基因的结构多样性,通过将每个基因的编码DNA序列(CDS)与其基因组DNA序列进行比较,利用基因结构显示服务器(GSDS)程序分析了内含子/外显子剪接。如图3所示,属于同一亚组的TkMADS和TmMADS成员的基因结构相似,但是I类和II类基因有所不同。菊苣蒲...
通过对以上29个当归MADS-box基因家族蛋白质、61个拟南芥和55个黄胡萝卜MADS-box蛋白质进行结构域和基序分析,结果显示,MADS-box蛋白质分为10个亚家族,与图2系统进化树关系一致,序列含有6个保守基序(表3);当归MADS-box同一亚家族蛋白质基序具有高度相似性,其中,SOC1亚家族均含有Motif 1～Motif 5;不同亚家族蛋白质...
madsbox基因家族保守结构域 MADS box基因家族是一类转录因子,它们在植物的发育过程中起着关键作用。这些基因编码的蛋白质包含一个保守的结构域,称为MADS盒(MCM1,AGAMOUS,DEFICIENS和SRF)。这个结构域由58-64个氨基酸组成,其中包含两个高度保守的α-螺旋。 MADS盒结构域的功能主要是识别和结合DNA,从而调控基因的表达...
研究结果表明,在现存十字花科早期共同祖先中至少存在50个MADS-box基因——19个tYype Ⅰ类基因和31个type Ⅱ类基因。 而后经历漫长的岁月,19个type Ⅰ类基因经基因加倍事件分化为现存十字花科植物最近共同祖先中的38个基因——13个Mα基因、7个Mβ基因和大概18个Mγ基因,并最终演化成现存十字花科植物中的38个...
它们的共同特点在于都包含一个高度保守的MADS-box结构域，这是基因功能的关键所在。这一结构域在不同生物体中发挥着相似的调控作用，体现了生命体在进化过程中对基因功能的保守性追求。在动物和真菌中，I型MADS-box基因的代表是ARG80/SRF-1like基因。这些基因在植物中则对应为M型MADS-box基因。而在...
基于全基因组,本研究鉴定了茭白的MADS-box基因,分析了其物理化学性质、进化关系、基因结构和保守motif,并分析了在不同光周期和温度下茭白叶片和茎顶分生组织(SAM)以及茎瘤初始阶段的MADS-box基因表达模式。 还研究了茭白发育阶段茎部高表达基因的表达变化。深入研究MADS-box转录因子家族对于阐明茭白茎瘤扩展的独特机制...
在春化通路中,FLC转录因子作为MADS-box家族核心转录因子之一,是抑制开花的关键,决定着拟南芥冬季开花习性。 FLC通过直接与编码开花激活产物的基因对FLC基因上的表观遗传修饰方式来实现,由于H3K27me3对FLC的修饰标记可持续存在,冷暴露条件下FL的转录表达。
MADS-box通常有两个保守的结构域:MADS和K结构域(其在pfam数据库中的号分别为:PF00319 and PF01486),作者利用pfam号在小麦基因组中查找MADS-box家族基因,共鉴定出201个M-I-K-C家族成员。 进化树表明家族成员可分成15个亚类,构树时也添加了水稻和拟南芥当中的MADS-box家族基因(下图黑色基因)。