MADS-box通常有两个保守的结构域:MADS和K结构域(其在pfam数据库中的号分别为:PF00319 and PF01486),作者利用pfam号在小麦基因组中查找MADS-box家族基因,共鉴定出201个M-I-K-C家族成员。 进化树表明家族成员可分成15个亚类,构树时也添加了水稻和拟南芥当中的MADS-box家族基因(下图黑色基因)。 比较基因组分析...
在春化通路中,FLC转录因子作为MADS-box家族核心转录因子之一,是抑制开花的关键,决定着拟南芥冬季开花习性。 FLC通过直接与编码开花激活产物的基因对FLC基因上的表观遗传修饰方式来实现,由于H3K27me3对FLC的修饰标记可持续存在,冷暴露条件下FL的转录表达。 FLC作为重要的开花抑制因子受到多个上游基因的调控,其中FRI可正向...
然而,前人的分析多集中在远源进化;其近源的分析少有人做,本研究欲丰富这一不足,聚焦于十字花科植物,以期揭示MADS-box基因家族的十字花科科内进化史。本研究首先分析了目前的27个已测序十字花科物种测序质量并结合现行十字花科植物分类系统确定有代表性的16个物种作为样本,并选取十字花科植物最近源的7个已测序物种...
甜菜 MADS-box 家族基因虽然基因结构差别较大,但蛋白序列相对保守。 基因表达谱显示,大部分MADS - box 基因优势表达于分生组织,部分 MADS-box 基因在种子、直根、幼叶等组织亦有较高表达。 部分 MADS-box基因响应盐、热胁迫轻微上调,可能参与甜菜逆境生理调控。关键词:甜菜;MADS-box;全基因组;家族基因中图分类号...
草莓MADS box基因家族生物信息学分析 摘要:通过生物信息学的方法,利用拟南芥、水稻的MADS-box基因对草莓MADS-box基因家 族进行鉴定和分析,共得到83个草莓MADS-box候选基因,且MADS-box结构域高度保守。 进化分析表明,FvMADS1-FvMADS33可被细分为10个亚组,分别为AG、AGL12、AGL6、AGL2、 ...
小麦中著名的开花基因VRN1和AP1就属于MIKC类型的MADS-box基因家族，在小麦春化和开花调控中发挥着重要作用。对该类基因家族的成员进行鉴定和分析，将有助于我们更好地理解该类基因的功能。普通小麦（中国春）中一共鉴定到201个MIKC类型的MADS-box基因成员，其中有164个基因同时含有MADS结构域和K结构域。这两个结构...
【目的】MADS-box蛋白是1种重要的转录因子,参与调控棉花生长发育进程。鉴定分析陆地棉MADS-box家族基因,可为研究其生物学功能奠定基础。 【方法】基于2019年最新组装的陆地棉TM-1参考基因组,通过HMMER 3.0软件鉴定陆地棉Type Ⅰ型及MIKC型MADS-b...
box 转录因子家族全基因组鉴定及表达分析 作者: 黄晓婧,张珺,夏惠,邓群仙,王进,吕秀兰,梁东 DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2018-0842 收稿日期: 2019-06-04 网络首发日期: 2019-08-26 引用格式: 黄晓婧,张珺,夏惠,邓群仙,王进,吕秀兰,梁东.葡萄 MADS-box 转录因子家族全基因组鉴定及表达分析.园艺学报....
分子进化树分析表明,57个大豆MIKC型MADS-box基因 分为14个亚类,而MIKC * 型基因又分为两个进化支。控制花形态建成的ABCDE同源异型基因(如AP1,AG, AP3和PI等)和重要的控制开花时间的基因(如SVP和SOC1)在大豆基因组中表现出多拷贝的特征。MEME 和SMART分析表明,大豆和拟南芥MIKC型MADS-box基因具有保守的MADS...
MADS-box基因家族是具有多种生物功能的转录因子,广泛参与植物的生长发育过程以及逆境应答.为了探索MADS-box基因家族在香蕉果实发育到后熟衰老过程中的功能,本文对71个香蕉MADS-box基因家族基因结构,蛋白的基本理化性质,二级结构预测,亚细胞定位,保守基序等方面进行初步生物信息学分析,结果显示:13个香蕉MADS-box基因没有内...