M6A-CLIP-seq将CLIP技术和高通量测序技术结合起来,用于研究RNA甲基化修饰m6A(N6-methyladenosine)的分布以及其与蛋白质的相互作用。m6A是一种常见的RNA内部化学修饰,在真核生物的转录和剪接中具有重要的功能。M6A-CLIP-seq可以帮助研究人员鉴定与m6A修饰相关的蛋白质,并确定它们与RNA的相互作用的位点和序列。 M6A-CLIP...
5. 比对准备 现在我们有了索引，我们可以比对我们的 ATACseq 读数。由于 ATACseq 数据通常是双端测序，...
m6A-seq 的数据分析通常侧重于整体分布模式和总体变化趋势，而 m6aclip-seq 则更关注修饰位点的局部特征及其与特定生物学过程的关系。两种技术在数据挖掘的思路和下游实验设计上也存在差异，m6A-seq 更适合于探索 m6A 修饰的普遍规律，而 m6aclip-seq 则更适用于深入研究 m6A 修饰的分子机制及其具体功能。
（2）筛选具体差异m6A peak和基因：差异m6A peak鉴定、非时序数据的分析策略、时序数据的分析策略、差异m...
High-Resolution Mapping of N6-Methyladenosine Using m6A Crosslinking Immunoprecipitation Sequencing (m6A-CLIP-Seq)N6-Methyladenosine, an abundant chemical modification in mRNA, plays crucial roles in regulating gene expression and biological processes. Research on m6A and its functions has progressed rapidly...
🍛//@Kdear傻傻clip:🍮🍮//@KDear邓氏鱼:👻//@古海洋生物:🍒//@古海洋生物: 迪玛希超话 谢谢你对我们大四川的关心,大家都要好好保重呀@迪玛希Dimash @迪玛希Dimash 向所有在四川地震中失去家人的朋友们表示哀悼! 所有正在寻找家人的朋友,你们一定要坚强! L迪玛希Dimash的微博视频 ...
@回形针PaperClip Sp.005【 关于新冠肺炎的一切 】 这场突然爆发的新型冠状病毒肺炎是如何发生和传播的?死亡率和传播速度有多高?如何降低被感染的可能性?在这支视频中,我们会试图回答你我关心的一切问题。 *关注我们的微博,在私信回复「肺炎」,可获取本期视频的文字稿和引用资料。L回形针PaperClip的微博视频...
机制研究表明,CDs通过增加甲基转移酶3 (METTL3)来增加辐照BMSCs的m6 A水平,进而导致Clip3降解。由此说明,CDs通过影响METTL3/Clip3轴介导的m6A修饰抑制辐射诱导的骨损伤。 Result1 枸杞CDs的合成与表征 本研究采用水热法从枸杞中制备CDs(图1a)。高分辨率透射电镜(HRTEM)图像显示,CDs分散良好,形状均匀,无明显聚集(...
CLIP-Seq用于检测RNA分子上的结合蛋白质,涉及结合反应的共价交联,接着通过RNA分子的酶切和纯化来进行CLIP-Seq。而在m6A-Clip-Seq中,则需要使用甲基化内切酶将RNA分子上的m6A修饰物识别出来,在RNA上形成裸核Ribonucleoside和基本的RNA结构,然后通过解压并钝化终止的加仑核苷,处理,并通过转录组方法进行测序。 通过对比m6A...
m6a-seq 只能鉴定m6A高甲基化的区域，并不能做到单碱基的分辨率，而m6a clip -seq方法能够对m6A做到单...