m6A-seq 的数据分析通常侧重于整体分布模式和总体变化趋势，而 m6aclip-seq 则更关注修饰位点的局部特征及其与特定生物学过程的关系。两种技术在数据挖掘的思路和下游实验设计上也存在差异，m6A-seq 更适合于探索 m6A 修饰的普遍规律，而 m6aclip-seq 则更适用于深入研究 m6A 修饰的分子机制及其具体功能。
m6A单碱基分辨率交联和免疫沉淀方法(m6A-CLIP/miCLIP)可以成功生成单碱基分辨率的m6A位点信息。该方法片段化的RNA与m6A抗体孵育,然后RNA-抗体复合物通过254 nm UV光交联,通过蛋白酶消化得到的氨基酸残基抑制逆转录中的碱基配对,导致在m6A位点附近发生片段化或突变,最终以单碱基分辨率获得m6A位点信息(图1A)。抗体和RNA的...
M6A-CLIP-seq将CLIP技术和高通量测序技术结合起来,用于研究RNA甲基化修饰m6A(N6-methyladenosine)的分布以及其与蛋白质的相互作用。m6A是一种常见的RNA内部化学修饰,在真核生物的转录和剪接中具有重要的功能。M6A-CLIP-seq可以帮助研究人员鉴定与m6A修饰相关的蛋白质,并确定它们与RNA的相互作用的位点和序列。 M6A-CLIP...
m6A单碱基分辨率交联和免疫沉淀方法(m6A-CLIP/miCLIP)可以成功生成单碱基分辨率的m6A位点信息。该方法片段化的RNA与m6A抗体孵育,然后RNA-抗体复合物通过254 nm UV光交联,通过蛋白酶消化得到的氨基酸残基抑制逆转录中的碱基配对,导致在m6A位点附近发生片段化或突变,最终以单碱基分辨率获得m6A位点信息(图1A)。抗体和RNA的...
m6A-cLIP: 用于检测m6A位点的高通量方法。 ScARLET: 一种高通量、单一位点的m6A检测方法。 MAZTER-Seq: 一种用于检测m6A位点的高通量方法。 RNAmod: 一种用于检测m6A位点的高通量方法。 FundMdeep-m6A: 一种用于检测m6A位点的高通量方法。 dART-Seq: 一种高通量、单一位点的m6A检测方法。 RNA Sequencing: 一种...
m6A单碱基分辨率交联和免疫沉淀方法(m6A-CLIP/miCLIP)可以成功生成单碱基分辨率的m6A位点信息。该方法片段化的RNA与m6A抗体孵育,然后RNA-抗体复合物通过254 nm UV光交联,通过蛋白酶消化得到的氨基酸残基抑制逆转录中的碱基配对,导致在m6A位点附近发生片段化或突变,最终以单碱基分辨率获得m6A位点信息(图1A)。抗体和RNA的...
m6A-cLIP: 用于检测m6A位点的高通量方法。 ScARLET: 一种高通量、单一位点的m6A检测方法。 MAZTER-Seq: 一种用于检测m6A位点的高通量方法。 RNAmod: 一种用于检测m6A位点的高通量方法。 FundMdeep-m6A: 一种用于检测m6A位点的高通量方法。 dART-Seq: 一种高通量、单一位点的m6A检测方法。
PA-m6A-seq、mi CLIP和m6A-CLIP提高了分析分辨率，但由于重复性差和工艺复杂。特别是，这些方法耗时（>2天）和费用昂贵。为了解决这些问题，m6A RNA甲基化片段富集试剂盒来了~艾美捷m6A-RNA甲基化片段富集试剂盒【简称：MeRIP试剂盒】有以下特点：1、高度富集：使用RNA 切割酶混合物同时对含有m6A 的目标序列两端的...
m6A单碱基分辨率交联和免疫沉淀方法(m6A-CLIP/miCLIP)可以成功生成单碱基分辨率的m6A位点信息。该方法片段化的RNA与m6A抗体孵育,然后RNA-抗体复合物通过254 nm UV光交联,通过蛋白酶消化得到的氨基酸残基抑制逆转录中的碱基配对,导致在m6A位点附近发生片段化或突变,最终以单碱基分辨率获得m6A位点信息(图1A)。抗体和RNA的...
m6A单碱基分辨率交联和免疫沉淀方法(m6A-CLIP/miCLIP)可以成功生成单碱基分辨率的m6A位点信息。该方法片段化的RNA与m6A抗体孵育,然后RNA-抗体复合物通过254 nm UV光交联,通过蛋白酶消化得到的氨基酸残基抑制逆转录中的碱基配对,导致在m6A位点附近发生片段化或突变,最终以单碱基分辨率获得m6A位点信息(图1A)。抗体和RNA的...