2018年,多伦多大学何厚胜课题组推出了微量RNA的MeRIP-seq技术,该技术从RNA的起始量、RNA片段化的条件、清洗/洗脱条件等角度优化了MeRIP-seq实验流程,使得MeRIP-seq所需肿瘤的总RNA最低降至2µg,打破了传统protocol的限制(Zeng et al 2018),主要流程如下(图6): 1)RNA片段化 RNA片段化的温度为70℃,片段化时间...
建立原位眼内异种移植模型以检查RB的致癌行为,病进行全基因组多组学分析以鉴定NSUN2的功能靶标,包括蛋白质组学分析,转录组筛选和m5C甲基化RNA免疫沉淀测序(m5C meRIP-seq)。研究结果表明,NSUN2介导的m5C RNA甲基化在RB的致癌过程中促进嘌呤的生物合成。 图:m5C MeRIP-seq鉴定NSUN2的潜在RNA靶标[3] 案例4:m7G...
我国学者最近开发了一种基于m6A敏感性RNA核糖核酸酶的测序技术（m6A-REF-seq）[22]，通过筛选出能特异区分ACA基序的RNA内切酶MazF，实现全转录组内以单碱基分辨率量化m6A水平。该方法不依赖于m6A抗体，大大降低了样本量，检测出的m6A位点与m6A-seq非常相似，但缺点在于该酶识别的m6A序列模式有限。m6A修饰在肿瘤中的生...
西班牙巴塞罗那大学(Universitat de Barcelona)Silvia Ginés团队利用MeRIP-seq等方法研究了m6A RNA 修饰在HD认知障碍中的潜在作用,研究结果发现m6A扰动是HD记忆损伤的一种新机制,鉴定出RNA修饰是HD的潜在治疗靶点。 标题:Altered m6A RNA m...
4. P. C. He, C. He, m6A RNA methylation: from mechanisms to therapeutic potential. EMBO J. 40, e105977 (2021).5. I. Barbieri, K. Tzelepis, L. Pandolfini, J. Shi, G. Millán-Zambrano, S. C. Robson, D. Aspris, V. Migliori, A. J. Bannister, N. Han, E. De Braekeleer, ...
2022年05月16日,《Cancer Res》杂志发表了题为“M6A RNA Methylation Regulates Histone Ubiquitination to Support Cancer Growth and Progression”的研究论文,该研究通过对骨肉瘤细胞系进行MeRIP-seq、RNA-seq、RIP、qRT-PCR等实验,揭示RNA去甲基化酶ALKBH5上调USP22和RNF40以抑制组蛋白H2A泛素化并诱导关键DNA复制和...
2020年12月,《J Cereb Blood Flow Metab》杂志发表了“Epitranscriptomic regulation by m6A RNA methylation in brain development and diseases”的综述文章,讨论了m6A调控的分子机制及其在大脑发育、生理和病理过程中的作用。 期刊:JOURNAL OF CEREBRAL BLOOD FLOW AND METABOLISM ...
参考文献:Yin H, Chen L, Piao S, Wang Y, Li Z, Lin Y, Tang X, Zhang H, Zhang H, Wang X. M6A RNA methylation-mediated RMRP stability renders proliferation and progression of non-small cell lung cancer through regulat...
本研究采用MeRIP- seq、荧光素酶报告基因实验、MeRIP等方法从RNA甲基化角度阐明NFATc1对破骨细胞的调控机制。此外,外泌体上EphA2过表达是靶向递送METTL14到破骨细胞的有效生物学方法。本研究表明外泌体释放的METTL14可以通过增加NFATc1的m6A甲基化水平来抑制破骨细胞,帮助绝经后骨质疏松患者保留骨量,避免引发颌骨坏死...
11、Parker, M.T., Knop, K., Sherwood, A.V., Schurch, N.J., Mackinnon, K., Gould, P.D., Hall, A.J., Barton, G.J., and Simpson, G.G. (2020). Nanopore direct RNA sequencing maps the complexity of Arabidopsis mRNA processing and m6A modification. Elife 9:e49658. ...