N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)修饰是真核生物mRNA转录后修饰中最常见、最丰富的化学修饰之一,由“Writer”甲基转移酶复合体(包括METTL3、METTL14及辅助因子WTAP等),“Reader” RNA阅读蛋白(包括YTH域家族YTHDF1-3、YTHDC1-2和IGF2 RNA结合蛋白家族IGF2BP1-3等),以及“Eraser”去甲基化酶(FTO和ALKBH5)...
m6A对RNA命运的决定是多样的,甚至可能是看似“矛盾”的,比如m6A促进mRNA的翻译,又促进mRNA的降解,而这个决定权则在m6A阅读蛋白“reader”手上——YTHDF1/3促进翻译,YTHDF2促进降解(图1)。但是目前对m6A的阅读蛋白识别m6A修饰的mRNA后,如何影...
N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)修饰是真核生物mRNA转录后修饰中最常见、最丰富的化学修饰之一,由“Writer”甲基转移酶复合体(包括METTL3、METTL14及辅助因子WTAP等),“Reader” RNA阅读蛋白(包括YTH域家族YTHDF1-3、YTHDC1-2和IGF2 RNA结合蛋白家族IGF2BP1-3等),以及“Eraser”去甲基化酶(FTO和ALKBH5)...
N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)修饰是真核生物mRNA转录后修饰中最常见、最丰富的化学修饰之一,由“Writer”甲基转移酶复合体(包括METTL3、METTL14及辅助因子WTAP等),“Reader” RNA阅读蛋白(包括YTH域家族YTHDF1-3、YTHDC1-2和IGF2 RNA结合蛋白家族IGF2BP1-3等),以及“Eraser”去甲基化酶(FTO和ALKBH5)...
该修饰发生过程由一系列蛋白复合物参与,研究人员将这些蛋白定义为Writer、Eraser和Reader,分别对应m6A修饰RNA的甲基转移催化酶、去甲基化酶和阅读蛋白。YTHDF2作为RNA上m6A修饰的一个重要阅读蛋白,其含有的YTH结构域,可以特异性地识别结合m6A修饰的RNA,并介导后者降解。m6A修饰普遍存在于各种RNA中,尤其在哺乳动物细胞中...
图1:巨噬细胞中YTHDF2的缺乏抑制了肿瘤的生长。RNA N6-甲基腺苷(m6A)甲基化是最常见的RNA甲基化类型,发生在腺苷的N6位,可以塑造TME。肿瘤细胞中m6A RNA甲基转移酶(如METTL3/METTL14)的耗尽会增强对PD-1抗体治疗的免疫反应, 而抑制m6A RNA去甲基化酶FTO或ALKBH5可使肿瘤细胞对依赖于或独立于PD-1/PD-L1抗体...
为了证实 m6A 在稳定性调控中的作用,通过敲除 m6A writer(METTL3、METTL14 和 WTAP)和reader(YTHDF2),发现敲除任意一个m6A writer,m6A 水平都明显下降,这与定量 LC-MS/MS 测定的 m6A 水平强相关。还发现在敲除任何一种writer后,甲基化程度降低较多的转录本的 RNA 稳定性更高。此外,研究人员还使用 METTL3 ...
m6A对于mRNA转录,剪切以及翻译等mRNA代谢的调控依赖于其识别蛋白,也就是m6A reader。在哺乳动物细胞内,目前发现有5种比较重要的m6A readers,包括YTHDF1/YTHDF2/YTHDF3以及YTHDC1和YTHDC2。这些蛋白的共同点是在他们的氨基酸序列中都...
图1 .巨噬细胞中YTHDF2缺失抑制肿瘤生长。 a b :Ythdf2f / f和Ythdf2c KO小鼠(每组n = 5)接种肿瘤后第15天,B16-OVA ( a )或MC38 ( b )肿瘤生长和肿瘤重量。 c d :在Ythdf2f / f和Ythdf2cKO小鼠尾静脉注射B16F10黑色素瘤细胞后第14天,B16F10肺转移灶( c ; n = 5),小鼠存活( d ; ...
核因子κB(nuclear factor κB,NF-κB)信号通路的激活也会促进血管生成进而促进胶质瘤的侵袭[58],YTHDF2通过促使NF-κB负调节因子UBX结构域包含蛋白1(UBX domain-containing protein 1,UBXN1)的降解,抑制其表达,激活NF-κB途径,促进胶质瘤细胞的迁移和侵袭[39]导致肿瘤进展。 3.3 YTHDF2与肿瘤干细胞 肿瘤干...