conda env create -f /your_path_to/LTR_retriever/LTR_retriever.yml Alternatively, you may use the conda recipe, but due to the large number of dependencies, conda solve may take hours... Unfortunately, the conda recipe currently could not be installed properly withmamba. ...
LTR_retriever is a highly accurate and sensitive program for identification of LTR retrotransposons; The LTR Assembly Index (LAI) is also included in this package. genome-annotationgenome-assemblyltr-retrotransposonslailtr-retriever UpdatedMar 24, 2025 ...
LTR_retriever不是一个独立的工具,他的主要作用就是整合LTRharvest,LTR_FINDER和/或MGEScan_LTR的结果,过滤其中的假阳性LTR-RT,得到高质量的LTR-RT库。 先下载LTR_retriever本体 1.git clone https://github.com/oushujun/LTR_retriever.git 之后修改LTR_retriever下的paths, 提供BLAST+, RepeatMasker, HMMER, CDH...
jfdwd/LTR_retriever 代码Issues0Pull Requests0Wiki统计流水线 服务 加入Gitee 与超过 1200万 开发者一起发现、参与优秀开源项目,私有仓库也完全免费 :) 免费加入 已有帐号?立即登录 master 分支(1) 标签(14) 管理 管理 master v2.9.0 v2.8.7 v2.8 ...
LTR_retriever结果问题老师您好，请问课程重复序列注释中，对于LTR_retriever结果文件，哪一个统计了 solo-...
LTR_retriever 是一个用于从基因组中检测和提取长末端重复序列(LTR)逆转录转座子的工具。LTR 逆转录转座子是真核生物基因组中常见的一类转座子,它们通过逆转录的方式在基因组中复制和插入,对基因组结构和功能具有重要影响。 LTR_retriever的主要功能包括: ...
LTR_retriever不是一个独立的工具,他的主要作用就是整合 LTRharvest, LTR_FINDER, MGEScan 3.0.0, LTR_STRUC, 和 LtrDetector的结果,过滤其中的假阳性LTR-RT,得到高质量的LTR-RT库。 先下载LTR_retriever本体 git clone https://github.com/oushujun/LTR_retriever.git ...
LTR_retriever不是一个独立的工具,他的主要作用就是整合LTRharvest,LTR_FINDER和/或MGEScan_LTR的结果,过滤其中的假阳性LTR-RT,得到高质量的LTR-RT库。 先下载LTR_retriever本体 git clone https://github.com/oushujun/LTR_retriever.git 之后修改LTR_retriever下的paths, 提供BLAST+, RepeatMasker, HMMER, CDHIT...
Discover & share this Golden Retriever Love GIF by Arenade Ph with everyone you know. GIPHY is how you search, share, discover, and create GIFs.
Update ltr_retriever - unpin repeatmasker pin <4.1.5 General instructions If this PR adds or updates a recipe, use "Add" or "Update" appropriately as the first word in its title. New recipes not directly relevant to the biological sciences need to be submitted to theconda-forge channel...