我们使用这种方法推断每个LRR-RLK亚类的完整基因树,并重建了整个基因家族的最深节点。我们发现LRR-RLK基因家族比以前认为的还要大,并且蛋白质域的增益和损失非常普遍。这些结构修饰,其中一些可能早于有胚植物的多样化,导致某些LRR-RLK变体被错误归类为其他基因家族的成员。我们的工作纠正了这种错误分类。我们的结果揭示...
本文首先通过生信分析鉴定疫霉菌基因组中均编码蛋白结构与植物LRR-RLK相似的LRR-RLK基因亚家族,发现相比于植物,疫霉菌LRR-RLK具有具有胞外域相对较短,LRR motif数量较少,激酶区与植物激酶独立进化的特点。利用CRISPR/Cas9基因编辑技术对大豆疫霉菌24个LRR-RLK(PsRLK)的生物学功能进行系统分析,发现LRR-RLK基因亚家族在...
【目的】从苹果全基因组中鉴定LRR-RLK家族蛋白成员,并进行生物信息学和表达模式分析,为研究苹果LRR-RLK的潜在功能提供理论基础。【方法】利用BLASTp基于GDR数据库鉴定苹果LRR-RLK家族成员,通过ExPASy Proteomics Server、Cell-PLoc、CD-Search Tool、MEGAX、MG2C等软件分析LRR-RLK蛋白序列基本信息、亚细胞定位情况、结构...
近日，河南农业大学园艺学院胡建斌教授团队在《农业科学学报》英文版（Journal of Integrative Agriculture，简称JIA）2024年10期上，发表了一项关于甜瓜种子大小的新研究。该研究揭示，LRR-RLK基因启动子上的一个等位基因变异（qSS1）与甜瓜种子大小密切相关。在前期研究中，科学家们从甜瓜的核心种质库中筛选出一种大种子...
【目的】从苹果全基因组中鉴定LRR-RLK家族蛋白成员,并进行生物信息学和表达模式分析,为研究苹果LRR-RLK的潜在功能提供理论基础。【方法】利用BLASTp基于GDR数据库鉴定苹果LRR-RLK家族成员,通过ExPASy Proteomics Server、Cell-PLoc、CD-Search Tool、MEGAX、MG2C等软件分析LRR-RLK蛋白序列基本信息、亚细胞定位情况、结构...
近日,我院郭振飞教授与华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室卢少云教授课题组合作在国际植物领域著名杂志The Plant Journal上在线发表了题为A novel LRR-RLK (CTLK) confers cold tolerance through regulation on CBF pathway, antioxidants and proline accumulation的研究论文。该研究从蒺藜苜蓿中鉴定...
拟南芥 RLK6属 于 LRR—RLKs(1eucine—rich repeat receptor—like kinases)亚家族基因 ,阿依江 ·哈拜克等对 RLK6及其编码蛋 白进行 了初步定位研究 ,发 现该基 因在花 中的表达量最高 ,且 RLK6蛋 白定位在 细胞膜 上 ,推测 RLK6在 花器 官生 长发 育或相关生理 收稿 日期 :2016~6-24 接受 日期...
WRKY70和LRR-RLK是两个与油菜抗病性密切相关的基因。WRKY70属于WRKY转录因子家族,具有调控植物抗病反应的功能;而LRR-RLK是一种具有亮氨酸重复序列的受体类蛋白激酶,在植物识别病原菌过程中发挥重要作用。为了进一步了解这两个基因在油菜抗病过程中的作用,我们利用VIGS技术进行功能验证。 四、实验方法 1.构建VIGS载体:...
对RNA进行杂交分析可以检测样品中的基因是否表达，表达水平如何。在基因表达检测应用中，荧光标记的探针常常是通过反转录酶催化cDNA合成RNA，在这一过程中掺入荧光标记的核苷酸。用于检测基因表达的RNA探针还可通过RNA聚合酶线性扩增克隆的cDNA获得。在cDNA芯片的杂交实验中，杂交温度足以除DNA中的二级结构，...
植物抗性育种是植物抵抗病原菌最有效方法之一.RLK基因家族中有不少未被鉴定出的抗病基因.富亮氨酸受体激酶家族(LRR-RLK)是RLK基因家族中的一大亚族.对LRR-RLK基因家族功能和进化模式,机制的研究将对植物抗病基因和其它功能基因合理,高效的利用具有十分重要的意义.本文首次从拟南芥,水稻,葡萄,杨树四个基因组的范围,系...