为了解决LRR-RLK基因树问题,我们开发了一种基于迭代隐马尔可夫模型搜索和系统发育推断的改进基因发现方法。我们使用这种方法推断每个LRR-RLK亚类的完整基因树,并重建了整个基因家族的最深节点。 我们发现LRR-RLK基因家族比以前认为的还要大,并且蛋白质域的增益和损失非常普遍。这些结构修饰,其中一些可能早于有胚植物的多...
不同的LRR-RLK蛋白亚组用不同的颜色表示。图1B展示了马尾松(Pinus massoniana)和拟南芥(Arabidopsis thaliana)同源基因的基序和系统发育树。红色箭头指向了选择进行进一步分析的基因。 图例说明: A部分:基于完整氨基酸序列的最大似然法构建的系统发育树。 B部分:展示了马尾松和拟南芥同源基因的基序和系统发育树,红色箭头...
【目的】从苹果全基因组中鉴定LRR-RLK家族蛋白成员,并进行生物信息学和表达模式分析,为研究苹果LRR-RLK的潜在功能提供理论基础。【方法】利用BLASTp基于GDR数据库鉴定苹果LRR-RLK家族成员,通过ExPASy Proteomics Server、Cell-PLoc、CD-Search Tool、MEGAX、MG2C等软件分析LRR-RLK蛋白序列基本信息、亚细胞定位情况、结构...
拟南芥 RLK6属 于 LRR—RLKs(1eucine—rich repeat receptor—like kinases)亚家族基因 ,阿依江 ·哈拜克等对 RLK6及其编码蛋 白进行 了初步定位研究 ,发 现该基 因在花 中的表达量最高 ,且 RLK6蛋 白定位在 细胞膜 上 ,推测 RLK6在 花器 官生 长发 育或相关生理 收稿 日期 :2016~6-24 接受 日期...
杨树LRR-RLK基因家族的生物信息学分析及木材发育相关基因的克隆 Populus LRR-RLK gene family bioinformatic analysis and cloning of genes involved in vascular development 学科专业：食品科学 研究生：袁炜 指导教师：王洁华副教授 天津大学化工学院 二零一二年十二月 ...
【目的】从苹果全基因组中鉴定LRR-RLK家族蛋白成员,并进行生物信息学和表达模式分析,为研究苹果LRR-RLK的潜在功能提供理论基础。【方法】利用BLASTp基于GDR数据库鉴定苹果LRR-RLK家族成员,通过ExPASy Proteomics Server、Cell-PLoc、CD-Search Tool、MEGAX、MG2C等软件分析LRR-RLK蛋白序列基本信息、亚细胞定位情况、结构...
最有效方法之一.RLK基因家族中有不少未被鉴定出的抗病基因.富亮氨酸受体激酶家族(LRR-RLK)是RLK基因家族中的一大亚族.对LRR-RLK基因家族功能和进化模式,机制的研究将对植物抗病基因和其它功能基因合理,高效的利用具有十分重要的意义.本文首次从拟南芥,水稻,葡萄,杨树四个基因组的范围,系统的研究了所有LRR-RLK的遗传...
LRR-RLK)是植物类受体蛋白激酶家族(RLK)中最大的亚家族.已有研究表明该亚家族基因在调控植物体生长发育和抗逆性方面发挥重要作用.拟南芥中At1g09970编码一个含976aa的蛋白质,蛋白预测分析显示该蛋白胞外区含有12个LRR结构单元,是LRR-RLK亚家族成员.本研究克隆该基因,分析突变体及过表达植物表型,描述此基因的表达模式...
河南农业大学园艺学院胡建斌教授团队发现甜瓜种子大小与LRR-RLK基因启动子变异相关 种子大小对甜瓜等瓜类作物而言至关重要，它不仅直接影响种子的萌发与后续幼苗的成长，还是实现机械化播种、促进农机农艺深度结合的关键因素，进而有助于提升播种的质量与效率。尽管种子大小的遗传机制已在多种农作物如水稻、小麦、花生以及...
全基因组重复与串联重复是发生基因重复的重要机制, 也是基因组和遗传系统多样化的重要动力.LRR-RLK编码富 含亮氨酸重复的类受体蛋白激酶, 是被子植物进化史上发生大规模扩张而形成的多基因家族.拟南芥(Arabidopsis thaliana) AtLRR-RLK包含15个亚家族, AtLRR VIII-2是其中发生串联重复比例最高的亚家族.通过分析拟南芥...