他们发现受测个体中55％的基因间（intergenic）lncRNA异常事件与附近的罕见变异有关，这表明与lncRNA基因表达相关的罕见变异会影响常见的复杂性状，将lncRNA与疾病性状联系了起来。为了进一步揭示lncRNA基因和疾病的相关性，他们通过数量性状表达位点与全基因组关联（Genome-wide association
基于深度集成学习的lncRNA-疾病关联预测研究 一、引言 随着生物信息学和基因组学的快速发展,长链非编码RNA(lncRNA)在生命活动中的重要性逐渐被揭示。lncRNA与多种疾病的发生、发展密切相关,其与疾病的关联预测研究已成为当前的研究热点。传统的生物信息学方法在处理大规模、高维度的lncRNA数据时,往往面临计算复杂度高...
基于深度学习与样本聚类的lncRNA疾病关联预测方法研究一引言随着生物信息学和计算生物学的快速发展,长链非编码RNAlncRNA在疾病发生发展过程中的作用逐渐被揭示。近年来,通过探索lncRNA与疾病的关联关系,有助于更好地理解疾病的发病机
MNDR (http:/mndr) [13]是哺乳动物非编码RNA-疾病关系在线知识库, 当前版本包含了807个lncRNA相关、229个mi RNA相关、13个pi RNA相关和100个snoRNA相关的数据条目。 2、 交叉验证为了评估算法的效果, 对于lncRNA-疾病关联关系预测, 通常对研究提出的模型进行留一交叉验证 (LOOCV) 或5-折交叉验证。其中, LOOCV...
采用CORRPLOT分析lncRNA与免疫细胞之间的相关性。 研究路线图 主要研究结果 1、差异lncRNA和mRNA表达谱的鉴定 房颤(AF)组和窦性心律(SR)组之间共有6个lncRNAs差异表达,与SR组相比,AF组有4个lncRNA上调,2个lncRNA下调(图1)。还分析了45种差异表达的mRNA,与SR组相比,AR组有31种mRNA表达下调,14种mRNA表达上调(...
首先，生信分析不仅能够帮助你解决论文发表需求，通过个性化分析，助你顺利毕业或晋升。它能揭示疾病中关键基因的功能，如lncRNA与免疫浸润的关系，比如探究lncRNA在房颤（AF）与窦性心律（SR）患者中的免疫细胞浸润差异，如B细胞、滤泡辅助性T细胞和静息树突状细胞的动态变化。以GEO数据库中AF的lncRNA和...
本发明涉及生物信息学中的数据挖掘领域,具体涉及一种融合异构网络与图神经网络的lncRNA与疾病关联预测方法.其发明内容主要包括:(1)收集相关数据;(2)计算疾病的语义相似性,疾病的靶标相似性,lncRNA的序列相似性,lncRNA的功能相似性(3)利用DDSsem,LLSfun,LDA,LMA,DMA构造异构网络net1;利用DDStar,LLSseq,LDA,LMA,...
一般关联指lncRNA/circRNA与疾病有关,但不是导致疾病的直接原因;因果关联则表示lncRNA/circRNA导致了疾病的发生。 本期小编将具体介绍LncRNADisease 3.0网站的使用方法。 进入官网(http://www.rnanut.net/lncrnadisease/index.php/home),页面左侧从上至下为网站内容概括、收录数据和更新内容,右侧上方为网站较之前...
3.根据权利要求1中的基于奇异值分解和图对比学习的lncrna-疾病关联预测,在所述的步骤2中,利用多源数据计算lncrna、mirna以及疾病的综合相似性矩阵,并构建三层异构图,用邻接矩阵m表示。具体步骤如下: 4.根据权利要求1中的基于奇异值分解和图对比学习的lncrna-疾病关联预测,在所述的步骤3中,利用奇异值分解,处理邻接...
图1. lncRNA基因和附近的蛋白质编码基因NKX2-3的位置。 该研究通过基因型-组织表达项目(GTEx)以及多种分析资源如数量性状表达位点(eQTL),加权基因共表达网络分析(WGCNA)和全基因组关联(GWAS)共定位分析,评估了lncRNA基因的调控模式,揭示了lncRNA在特定细胞环境中与各种复杂性状和疾病的联系。研究中确定了1,432个...