结合了lncRNA微阵列分析和lncRNA文库构建/lncRNA-seq的结果,发现LncRNA-AK058030(即为PMAN)在PM中高表达,并受HIF-1α的调控(图1G)。通过Kaplan-Meier分析,发现PMAN的高表达与GC总生存率较差存在相关性,这表明PMAN可能是PM的潜在生物标志物(图1H)。高表达PMAN组66.7%的患者术后发生PM,低表达PMAN组仅20%的...
先将RNA进行标记(如生物素标记),再与细胞裂解液共同孵育,从而形成RNA-RNA/蛋白质复合物,进而检测与之结合的RNA或蛋白质。复合物洗脱后,通过荧光定量PCR(RNA pull down-QPCR)或高通量测序(RNA pull down-seq)方法来鉴定目标RNN是否与某些RNA分子相互作用,通过Western blot(pull down-WB)实验和质谱(pull down--MS...
首先，lncRNA更常被称为“长链非编码RNA”，而linc RNA则是“长链内含子RNA”的简称。从字面上看，...
【佳学基因】什么是lncRNA基因检测?lncRNA是人体的基因序列调控人的疾病发生和生长发育过程的一种形式。很多基因检测机构没有把它列入基因检测的范围。基因解码揭示lncRNA的序列变化会引起【佳学基因检测】什么是lncRNA基因检测?基因检测技术导读:lncRNA是人体的基因序列调控人的疾病发生和生长发育过程的一种形式。很多...
总而言之,任何一篇针对由芯片或者RNA-seq测序筛选而得到的显著差异表达的lncRNA研究文章,均需要通过后续一系列大量实验,如表达验证、功能验证以及关键的互作验证(研究其作用机理)实验等,来搭成向高分文章晋级的阶梯(见下图)。 因而,只要各位小伙伴们能通过以下实验将lncRNA的身家背景调查的清清楚楚,终会攀爬到别人没...
使用ssRNA-Seq(Strand-Specific)能够保留RNA的方向性信息,可以确定转录本来自正链还是负链,以便更加准确的获得基因的结构以及基因表达信息。 3.预测lncRNA与mRNA、miRNA互作的方法? 1)cis调控预测,筛选的条件只有cis location是100kb。(同一条染色体上距离lncRNA100kb的mRNA,都会被列入到cis调控的可能) 2)trans调控...
RNA pull-down是研究细胞内RNA与蛋白/RNA结合情况的技术。先将RNA进行标记(如生物素标记),再与细胞裂解液共同孵育,从而形成RNA-RNA/蛋白质复合物,进而检测与之结合的RNA或蛋白质。复合物洗脱后,通过荧光定量PCR(RNA pull down-QPCR)或高通量测序(RNA pull down-seq)方法来鉴定目标RNN是否与某些RNA分子相互作用,...
复合物洗脱后,通过荧光定量PCR(RNA pull down-QPCR)或高通量测序(RNA pull down-seq)方法来鉴定目标RNN是否与某些RNA分子相互作用,通过Western blot(pull down-WB)实验和质谱(pull down-MS)技术检测目标RNA是否与某些蛋白相互作用。 RNA Pull down技术原理...