lncRNA分析跟常见的mRNA-seq分析重合度很高,无非也是把测序的fastq文件mapping到参加基因组,获取转录本信息,转录本表达定量,表达量的差异分析,比较新的分析就是把转录本分成了lncRNA和mRNA,这样可以考虑它们之间的互相作用,也可以在实验设计的时候加入miRNA和CHIP-seq,这样多种数据结合分析,显得更高大上一点,也能更好...
LncRNA-seq报告解读 29:17 meRIP-seq报告解读 42:10 miRNA-seq报告解读 28:25 RNA-seq报告解读 01:17:19 RRBS分析demo报告解读 21:09 WGBS分析demo报告解读 49:17 WGCNA分析 10:37 全基因组测序WGS报告解读 34:20 全外显子测序WES报告解读 24:14 cellxgene操作演示 06:59 单细胞 V(D)...
LncRNA-seq报告解读, 视频播放量 153、弹幕量 0、点赞数 3、投硬币枚数 0、收藏人数 9、转发人数 0, 视频作者 吉凯基因, 作者简介 吉凯基因B站唯一官方号,您的科研小助手,相关视频:KEGG通路注释与富集分析,circRNA-seq报告解读,全基因组测序WGS报告解读,meRIP-seq报告
为了研究植物中lncRNA对基因表达的调控功能,作者对样本total RNA进行rRNA去除后进行链特异性RNA-seq,结合生物信息学分析方法,系统鉴定和分析了模式植物拟南芥中的lncRNA。该研究共鉴定到了6510个lncRNA,其中包括4050个NAT-lncRNA以及2460个LincRNA(图2)。 图2:LncRNA在拟南芥中的注释。 该研究发现,在不同组...
自学lncRNA-seq数据分析的路径清晰且系统，以标准RNA-seq定量流程为起点，针对gencode数据库的gtf文件获取包含lncRNA和mRNA的表达矩阵。利用这一矩阵，可以进行火山图、热图、GO/KEGG数据库注释等分析，以深入了解表达差异。无论是通过芯片还是测序技术进行lncRNA分析，目标都是揭示表达差异，了解lncRNA与mRNA...
LncRNA-seq 产品介绍: 长链非编码 RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度⼤于200个核苷酸的非编码RNA。研究表明,lncRNA在表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多⽣命活动中发挥重要作用。它主要是利用高通量测序技术进⾏lncRNA 测序,并结合⽣物信息学的预测工具进⾏lncRNA 分析,分析lncRNA与特...
生物信息学进展lncRNA-Seq数据分析.ppt,基本筛选主要由五个部分组成 step1: 对所有样品拼接得到的转录本使用cuffcompare软件进行合并,选择同时被两种拼接软件拼接到,或者同时出现在至少两个样品中的转录本; step2: 选择转录本长度=200bp,Exon个数=2的转录本; step3: 通
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● 测序平台:Hiseq X 10/Nova seq ● 测序类型:PE150 ● 测序数据量:10 G/样本 lncRNA测序实验流程 lncRNA测序分析流程 样品要求(RNA) 1) 样品纯度:OD 260/280值应在1.9～2.2 之间。 2) 样品浓度:最低浓度不低于100ng/ul。 3) 样品总量:每个样品总量不少于2µg。
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