(2)lncRNA表达调控研究:LncRNA-Seq用于研究不同细胞类型、组织、发育阶段、生理状态或疾病状态下lncRNA的表达变化,帮助了解lncRNA在基因调控中的作用。 (3)lncRNA与疾病关联研究:通过比较疾病患者和正常对照组的lncRNA表达数据,可以鉴定与疾病相关的lncRNA,从而深入了解lncRNA在疾病发生机制中的作用。 (4)lncRNA与...
lncRNA分析跟常见的mRNA-seq分析重合度很高,无非也是把测序的fastq文件mapping到参加基因组,获取转录本信息,转录本表达定量,表达量的差异分析,比较新的分析就是把转录本分成了lncRNA和mRNA,这样可以考虑它们之间的互相作用,也可以在实验设计的时候加入miRNA和CHIP-seq,这样多种数据结合分析,显得更高大上一点,也能更好...
LncRNA-seq报告解读 29:17 meRIP-seq报告解读 42:10 miRNA-seq报告解读 28:25 RNA-seq报告解读 01:17:19 RRBS分析demo报告解读 21:09 WGBS分析demo报告解读 49:17 WGCNA分析 10:37 全基因组测序WGS报告解读 34:20 全外显子测序WES报告解读 24:14 cellxgene操作演示 06:59 单细胞 V(D)...
lncRNAseq的一般分析流程主要包括以下步骤：数据质量控制：对原始的测序数据进行质量检查，包括读取长度、碱基质量分布、测序深度等，以确保数据质量满足后续分析的要求。序列映射：将高质量的测序读段映射到参考基因组上，通常使用如HISAT2、TopHat等工具。这一步的目的是确定每个读段在基因组上的位置，为...
9. 非编码RNA(lncRNA)定量及差异表达分析 10. 非编码RNA(lncRNA)功能预测 案例:通过RNA测序分析帕金森病中白血球的长链非编码RNA及选择性剪接的调控 背景:人类寿命的延长伴随着神经退行性疾病的发病几率的增加,因而价格不贵的血液诊断的发展迫在眉睫。通过RNA-seq分析血液细胞的转录本是发现新的生物标志物的非常高...
自学lncRNA-seq数据分析的路径清晰且系统，以标准RNA-seq定量流程为起点，针对gencode数据库的gtf文件获取包含lncRNA和mRNA的表达矩阵。利用这一矩阵，可以进行火山图、热图、GO/KEGG数据库注释等分析，以深入了解表达差异。无论是通过芯片还是测序技术进行lncRNA分析，目标都是揭示表达差异，了解lncRNA与mRNA...
参考报价:￥2800-3300品牌:碧云天产地:上海型号:长链非编码RNA测序(lncRNA-Seq)样本:来电或留言获取样本 留言咨询电话咨询 AI问答 长链非编码RNA测序(lncRNA-Seq)碧云天NGS测序高通量测序服务介绍价格?可以检测什么? 长链非编码RNA测序(lncRNA-Seq)碧云天NGS测序高通量测序服务介绍参数规格?配套的耗材试剂?
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生物信息学进展lncRNA-Seq数据分析.ppt,基本筛选主要由五个部分组成 step1: 对所有样品拼接得到的转录本使用cuffcompare软件进行合并,选择同时被两种拼接软件拼接到,或者同时出现在至少两个样品中的转录本; step2: 选择转录本长度=200bp,Exon个数=2的转录本; step3: 通
● 测序平台:Hiseq X 10/Nova seq ● 测序类型:PE150 ● 测序数据量:10 G/样本 lncRNA测序实验流程 lncRNA测序分析流程 样品要求(RNA) 1) 样品纯度:OD 260/280值应在1.9～2.2 之间。 2) 样品浓度:最低浓度不低于100ng/ul。 3) 样品总量:每个样品总量不少于2µg。