代谢组学文献分享，因此，Paola Picotti课题组利用代谢物与蛋白结合会引起蛋白质结构改变的特点，开发了新的Limited (or native) proteolysis-small molecule mapping(LiP-SMap)法用于研究小分子代谢物和蛋白之间的相互作用，并开始在全蛋白组水平上系统地分析和定量了蛋白与代谢物间的相互作用，并建立了它们之间的关系。
图2.代谢物与蛋白相互作用图(A:中心碳代谢网络图; B:基于LiP-SMap检测出的作用位点; C:1,678个LiP-SMap相互作用位点的得分分布; D:以GTP为代表的结合位点结构) 4. 代谢组学文献分享—代谢物和蛋白相互作用特征与新调节方式发现 通过分析代谢物敏感的蛋白与E.coli的“核心蛋白组”之间的关系发现,代谢物更倾向...
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代谢组学文献分享,因此,Paola Picotti课题组利用代谢物与蛋白结合会引起蛋白质结构改变的特点,开发了新的Limited (or native) proteolysis-small molecule mapping(LiP-SMap)法用于研究小分子代谢物和蛋白之间的相互作用,并开始在全蛋白组水平上系统地分析和定量了蛋白与代谢物间的相互作用,并建立了它们之间的关系。 2...
2. 代谢组学文献分享—LiP-SMap法技术路线与方法验证 如图1,与之前的Lip-SRM法[1,5]类似,首先在非变性的条件下提取蛋白质,然后将提取的蛋白分为两组,一组加入小分子代谢物,让其与蛋白质相互作用,另一组不进行任何处理;再加入广谱的蛋白酶K(PK)产生结构特异性蛋白片段;得到的特异片段再经序列特异性的Trypsin...
2.代谢组学文献分享—LiP-SMap法技术路线与方法验证 如图1,与之前的Lip-SRM法[1,5]类似,首先在非变性的条件下提取蛋白质,然后将提取的蛋白分为两组,一组加入小分子代谢物,让其与蛋白质相互作用,另一组不进行任何处理;再加入广谱的蛋白酶K(PK)产生结构特异性蛋白片段;得到的特异片段再经序列特异性的Trypsin酶...
2.代谢组学文献分享—LiP-SMap法技术路线与方法验证 如图1,与之前的Lip-SRM法[1,5]类似,首先在非变性的条件下提取蛋白质,然后将提取的蛋白分为两组,一组加入小分子代谢物,让其与蛋白质相互作用,另一组不进行任何处理;再加入广谱的蛋白酶K(PK)产生结构特异性蛋白片段;得到的特异片段再经序列特异性的Trypsin酶...