sudo apt install openjdk-11-jdk 然后也是运行LigPlus.jar,界面一样 下面是准备好受体配体复合物文件,如果是蛋白复合物,确保蛋白的链名称是A,B 否则可能不识别。 打开一个VEGF看看 可以拖动鼠标修改元素位置,也可以点edit修改字号等 通过File--Write PS file保存图片,用ps可以打开。 还可以点右下角的pymol,用p...
分子对接 二维可视化软件 ligplot 的下载安装与使用 链接:https://pan.baidu.com/s/1483MhfehugI8u0lNqRtu1Q, 视频播放量 27000、弹幕量 10、点赞数 375、投硬币枚数 197、收藏人数 1136、转发人数 313, 视频作者 甜橙zzz, 作者简介 网络药理学、分子对接相关内容分享,155
LigPlot是EMBL-EBI开发的软件,用于以2D方式展示分子对接结果,LIGPLOT,绘制蛋白质和小分子之间的相互作用;DIMPLOT,绘制蛋白之间的相互作用;Antibody plot,绘制抗原抗体之间的相互作用。其余软件还有PLIP和PoseViewer,我后续再补上。 1,使用edu邮箱申请(https://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/software/LigPlus/applicence....
分子对接 二维可视化软件 ligplot 的下载安装与使用 链接:https://pan.baidu.com/s/1483MhfehugI8u0lNqRtu1Q 2.7万播放 如何编织一条欺骗全国媒体的谎言? 354.2万播放 卧槽!妹子被夹击,内脏全碎肠子都出来了,惨啊 68.7万播放 不写一行代码,开发一款属于自己的游戏 140.6万播放 用GPT4进行生信分析!(中英字幕)...
我将对接的酶与小分子放到同一个pdb文件下了，用ligplot打开后该怎么选择呢，点击run之后总是提示unable...
分子对接结束后，对接软件中可以显示小分子与氨基酸的之间形成的氢键，但是ligplot 无法显示，官网的教程看...
现在我做了一个酶与二肽的对接,用ADT对配体、受体进行了处理,然后本地运行vina得出分值,以及输出了结果。下一步想做ligplot,软件是ligplot+v 1.4.5,运行的时候是需要将分子对接的配体-受体合成一个pdb格式才能运行吗? 另外,因为vina我也是自学的,虽然可以运算得出分值,但不知道中间有没有错误的地方,求大神指教...
分子对接结束后，对接软件中可以显示小分子与氨基酸的之间形成的氢键，但是ligplot 无法显示，官网的教程看...