1. 软件安装 1.1 windows安装教程 首先配置: anaconda,为了需要conda环境 git,为了下载github中的ldsc程序 打开windows电脑中的promote: 键入命令: gitclonehttps://github.com/bulik/ldsc.git cdldsc condaenvcreate--fileenvironment.yml sourceactivateldsc 可以看到,正在从github中下载ldsc程序: 正在创建conda环境...
https://github.com/bulik/ldsc 1. 软件安装 1.1 windows安装教程 首先配置: anaconda,为了需要conda环境 git,为了下载github中的ldsc程序 打开windows电脑中的promote: 键入命令: 代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 AI代码解释 git clone https://github.com/bulik/ldsc.git cd ldsc conda env create--...
然后下载Anaconda的linux版本(https://www.anaconda.com/products/distribution),下载后按照教程一步一步安装(https://anaconda.cloud/support-center/installers),安装到最后一步可以将其配置到环境变量里,这样就可以直接使用Anaconda的相关功能了。 LDSC最简单的安装方法就是官网提供的(https://github.com/bulik/ldsc...
1. 软件安装 1.1 windows安装教程 首先配置: anaconda,为了需要conda环境 git,为了下载github中的ldsc程序 打开windows电脑中的promote: 键入命令: git clone https:///bulik/ldsc.git cd ldsc conda env create --file environment.yml source activate ldsc 1. 2. 3. 4. 可以看到,正在从github中下载ldsc...
git clone https://github.com/bulik/ldsc.gitcd ldsc ② 安装ldsc依赖的环境 conda env create --file environment.ymlsource activate ldsc ③ 测试是否安装成功 如果安装成功,输入./ldsc.py -h代码会出现如下图: ④ 准备summary文件summary.txt su...
通过ldsc这款软件,可以方便地进行LDSC分析,源代码保存在github上,网址如下 https://github.com/bulik/ldsc 采用了conda来确保软件独立的安装环境,安装过程如下 git clone https://github.com/bulik/ldsc.git cd ldsc conda env create --file environment.yml ...
git clone https://github.com/bulik/ldsc.git cd ldsc conda env create --file environment.yml source activate ldsc 以上步骤完成后,可以输入以下命令来检测是否安装成功 ./ldsc.py -h./munge_sumstats.py -h 除此以外,还需要相应群体的LD score,好消息是作者提供了处理好的欧洲 European 与 东亚 Eas...
01下载与安装 ldsc:https://github.com/bulik/ldsc. 这里以服务器为例,LDSC软件在github中可以获取,同SMR一样是一种可执行脚本,LDSC是python脚本,运行需要搭配anaconda环境,anaconda下载与安装网上有很多教程,如果后面大家还是不太会,可以留言我再写一期。
通过ldsc这款软件,可以方便地进行LDSC分析,源代码保存在github上,网址如下 https:///bulik/ldsc 采用了conda来确保软件独立的安装环境,安装过程如下 git clone https:///bulik/ldsc.git cd ldsc conda env create --file environment.yml ...
在Windows系统上安装LDSC,首先需构建适宜的Python环境。 配置环境:建议安装Anaconda,它提供的conda环境管理器能轻松创建和切换不同的Python环境。同时,安装Git以便从GitHub上克隆LDSC代码库。 下载并安装LDSC:打开命令行窗口,输入以下命令: git clone https://github.com/bulik/ldsc.git cd ldsc conda env create ...