LC-MS非靶向代谢组学 非靶向代谢组学(Untargeted Metabolomics)主要是利用色谱-质谱联用技术,结合自建数据库或公共数据库对样本中代谢物进行搜库定性和相对定量的代谢组学方法,具有高通量、广覆盖的特点。主要研究思路针对对照组和处理组中检测到的代谢物通过单维和多维统计方法筛选出差异代谢物,再进行代谢通路分析进而阐...
基于LC-MS的代谢组学技术,由于其较高的灵敏度,可以用于识别代谢物、监测代谢组的转变,并揭示检测到的代谢物及其生物合成途径。在本研究中,应用基于LC-MS的非靶向代谢组学技术旨在广泛筛选感兴趣的代谢物,通过对枯草芽孢杆菌DC-15发酵豆渣在不同发酵时间(0和48 h)所测得的增值代谢产物进行相对定量分析,建立代谢模...
代谢组学是继基因组学和蛋白组学之后发展起来的一门组学学科,非靶向代谢组学是无偏向性对所有小分子代谢物(相对质量小于1500)同时进行检测分析的代谢组学。 LC-MS是指液相色谱-质谱联用技术,该技术对待测组分的挥发性和热稳定性没有要求,不需要繁琐的衍生化步骤,样品前处理简单,检测温度低,分离物质快速、高效,是...
本篇运用16S rRNS测序及LC-MS代谢组学研究表明,由谷物制成的ogi菌群具有多样性,且真菌毒素显著降低。而文章选用的三种谷物中,尤以FM品种对ogi加工阶段影响最大。通过数据和食品方面分析,谷物品种优于玉米,是一种可行的替代品。小鹿推荐 本片文章通过LC-MS靶向代谢组学和16S rRNA基因序列分析,探究谷物在加工传...
2.2代谢组学实验结果稳定性分析经LC-MS质谱分析和QC矫正后,对进展期白癜风患者和健康对照者血液样本间的正负离子模式分别进行PCA和OPLS-DA分析,结果显示,无监督PCA模型下分离趋势不明显(图1a~1b),经过监督的OPLS-DA模型显示较好的分离效果(图1c~1d);200次置换检验(permutationtest)提示实验结果稳定,可重复性好(图...
该文章结合转录组学、GC-MS非靶向代谢组学、LC-MS非靶向代谢组学分析,探讨了不同季节间差异代谢物的生物合成机制,季节变化影响主要集中在光合作用途径、萜类化合物、类黄酮生物合成途径,为柳杉的适应机制及其代谢物的提取提供参考。进一步阐明植物在特定生理生态条件下的适应和调控机制。
• 主要代谢组学研究方法 • 数据处理 一、数据采集 • 传统LC-MS – 传统LC-MS特征 – 传统LC-MS测试策略 一、数据采集 • 毛细LC-MS – 毛细LC-MS特征 – 与传统LC-MS比较 一、数据采集 • UPLC-MS –UPLC-MS特征 – 与传统LC-MS比较 一、数据采集 • 示例 一、数据采集 • 在线分析...
本篇由江南大学陈卫博士课题组发表在在Metallomics杂志发表题为“Comparative metabolomic analysis reveals global cadmium stress response of Lactobacillus plantarum strains”的研究论文,该研究报道了植物乳杆菌菌株在体内对镉毒性的保护作用,本文作者通过运用LC-MS代谢组学技术对其中的调控机制做了初步的探索。
基于LC-MS和代谢途径分析表明,枯草芽孢杆菌DC-15可以加速复杂大分子的分解,从而改善发酵豆渣的营养和功能,差异代谢产物主要为氨基酸、二肽、脂肪酸、小分子糖和维生素等物质。该研究发现485种代谢物富集在代谢相关通路中,包括能量代谢、脂...
随着分析方法的发展和完善,基于LC-MS的植物代谢组学已成功应用于代谢表型差异、转基因植物安全性评价、生物及非生物胁迫、植物基因功能鉴定、辅助育种等多个研究方向。常玉玮中国科学院遗传与发育生物学研究所王国栋中国科学院遗传与发育生物学研究所生命科学LC-MS在植物代谢组学分析中的应用[J]. 常玉玮,王国栋.生命...