随着分析方法的发展和完善,基于LC-MS的植物代谢组学已成功应用于代谢表型差异、转基因植物安全性评价、生物及非生物胁迫、植物基因功能鉴定、辅助育种等多个研究方向。常玉玮中国科学院遗传与发育生物学研究所王国栋中国科学院遗传与发育生物学研究所生命科学LC-MS在植物代谢组学分析中的应用[J]. 常玉玮,王国栋.生命...
LC-MS和GC-MS技术是目前代谢组学研究常用的两大技术平台,但使用单一平台物质检测的范围和种类,都有一定的偏向性和局限性。为了解决这个问题,提出LC-MS+GC-MS联合组合式双平台,可以大大提升代谢组学检测的覆盖度,获取更加全面的代谢物及其丰度信息。GC-MS&LC-MS双平台从实验过程到代谢物质谱数据库以及项目报告...
研究者们对不同属的番茄的多酚代谢物进行研究,分析其潜在的生物合成和修饰反应,构成了多酚代谢网络。利用LC-MS技术提取番茄和野生番茄不同组织(未成熟果实、成熟果实、叶、茎和根部)的代谢物,分析不同组织中特异性代谢物的种类。基于代谢组学分析,发现了7个番茄品种在果实成熟时期代谢产物发生的整体变化,紧接着采用...
(1)LC-MS平台对代谢物的覆盖最广、灵敏度更高。从文献中已报道的同时使用多种分析平台的数据来看,都是LC-MS获得的数据量显著更多;(2)相比于GC-MS,LC-MS一般无需衍生处理,分析平行性更好,更适合大规模样本的分析;(3)使用LC-MS平台的人员和机构更多,包括很多做NMR和GC-MS的代谢组学专家都已转向L...
通过液质联用(LC-MS)方法检测生物体受外界刺激前后体内大多数小分子代谢物的动态变化,重点寻找在实验组和对照组中有显著变化的代谢物,进而研究这些代谢物与生理病理变化的相关关系,其研究对象大多是分子量1500Da以内的小分子物质。 技术优势 较高的灵敏度、分辨率; ...
将重点介绍目前基于LC-MS的代谢组学分析方法及其在临床研究中的应用。 液相色谱-质谱法:实用方法 液相色谱法(LC)分离 代谢组由各种高达1.5kDa的代谢物组成,具有不同的理化性质和广泛的浓度范围,因此需要一种以上的分析分离技术,以互补的方式加以覆盖。液相色谱-质谱联用(LC-MS)是代谢组学研究最常用的平台之一[20...
UPLC-ESI-MS/MS 分析:基于 UPLC-ESI-MS/MS 对苦荞瘦果中的类黄酮和酚酸类成分进行定性分析,并建立靶向代谢组学方法。基于所建立的代谢组学方法对黑色和黄褐色苦荞瘦果的三个关键发育时期进行代谢组学分析。 AP-SMALDI MSI 分析:将用于 UPLC-ESI-MS/MS 分析的相同苦荞瘦果材料用于 MALDI-MSI 分析。基于 MALDI-...
代谢组学是继基因组学、转录组学、蛋白质组学之后兴起的又一新的组学研究分支,但其研究技术方法一直以来都是影响代谢组学发展的瓶颈之一。LC-MS技术结合化学计量学比较好地实现了对大量样品和微量代谢物的快速定性、定量分析,极大地推动了代谢组学的发展。
一共从未处理和处理的茶叶细胞中检测到9007个代谢物,其中用GC-MS代谢组学鉴定到447个代谢物,LC-MS代谢组学鉴定到8560个代谢物。碳水化合物、氨基酸、有机酸等是主要代谢产物。进行了PCA和OPLS-DA分析(图2),根据PCA和OPLS-DA数据,未处理和处理的样品有明显的差异(图2a)。GC-MS代谢组学数据的主成分分析...