3. 离心10 min(13000 rpm ,4℃),取150 μL上清液装入带有支脚内衬管的LC-MS进样小瓶中进行分析; 4. 质控样本(QC)由所有样本的提取液等体积混合制备而成,QC的体积与样本相同。 B 生物学重复数 动物样本:6-8次以上生物学重复 菌体/菌液:6-8次以上生物学重复 临床样本:30次以上生物学重复,罕见病尽量多...
在代谢组学研究中，它已成为最常用的衍生化方法。然而，柱前衍生化也存在一定的局限性，如可能引入杂质，过量的衍生化试剂可能干扰产物检测，特别是在LC-MS靶向代谢组学中，与检测器不兼容的衍生化试剂需要进行后处理。柱后衍生化：这种方法允许直接将衍生化反应应用于已建立的代谢物原型分析方法，从而缩短分析方法的...
柱前衍生化：这种衍生化方法允许相对自由的反应条件选择，不受反应动力学的限制，且允许多步反应的进行，因此在代谢组学研究中被广泛采用。然而，柱前衍生化可能会引入杂质，过量的衍生化试剂进入仪器时可能干扰产物检测，特别是在LC-MS靶向代谢组学中，需要确保所使用的衍生化试剂与检测器兼容。柱后衍生化：该方法可...
数据分析可谓是代谢组学研究的 “关键限速步骤”(图3),我们可以将它分解成4个步骤来完成: 1.原始数据处理:通过基线校正、峰对齐、峰识别、缺失值填充、数据过滤、归一化处理等方式将原始数据中的代谢物信息进行提取并转换成可用于数据分析的形式。 2.统计分析:主要包含单统计分析 (Fold change、T test、Volcano Pl...
2 基于质谱的代谢组学 质谱 (MS) 方法因其较宽的动态范围,高 灵敏度,高重现性以及分析复杂生物体液 的能力,已被广泛用于代谢组学研究.为 了解决样品复杂性问题,通常将分离手段 (气相色谱,液相色谱或毛细管电泳)与质 谱分析进行串联,以检测到尽可能多的代谢 物.质谱信息和分离实验的保留时间(或 迁移时间)中所...
方法二: 没有标准品,就只用面积相对定量。然后选用LC-MS/MS的SIM模式(样品杂质比较少,选择同位素丰度为100%的分子量,上下增减0.2)。考察因素导致的量的改变比较微量,选择一种物质为回收率指示物(反应液前处理前加入),一种物质为...
非靶向代谢组学（Untargeted metabolomics）是一种分析生物样本中所有可检测代谢物的方法。其中LC-MS非靶向代谢组学是一种利用液相色谱-质谱联用技术（LC-MS）无偏向性地检测生物体内所有小分子代谢物的动态变化的技术。由于环境对生物体的影响会最终体现为代谢物的变化，因此LC-MS非靶向代谢组学在动物生长发育、疾病...
LC-MS灵敏度较高,能分离上千种小分子代谢物,检测限为ppb(即十亿分之一),可用于痕量分析。GC-MS 在代谢组学的研究中除了作为靶向性物质的分析,亦或作为LC-MS非靶向性代谢组学的热稳定化合物的一种补充。两者因为流动相和检测原理的差别,从而得到的数据也是有一定区别的。下面我们将从数据库、离子源、数据形式...
基于液质联用(LC-MS)的非靶向和靶向代谢组学应用促进了新生物标志物的发现,并有助于人们提高对各种疾病机制的理解。人们已经报道了许多策略来扩大LC-MS-非靶向和靶向代谢组学中的代谢物覆盖范围。为了提高低丰度或低电离代谢物的灵敏度,人们针对不同...
用非靶向代谢组检测来说,无论是使用GC-MS还是LC-MS/MS,了解其工作原理,对样品前处理,样品检测方式,数据分析等都会有很大的提升。质谱仪扫描模式的区别、两种检测方式检测的下机数据如何分析,差异代谢物筛选,都是代谢组检测和分析的重难点,看下表格具体了解差异: ...