3. 离心10 min(13000 rpm ,4℃),取150 μL上清液装入带有支脚内衬管的LC-MS进样小瓶中进行分析; 4. 质控样本(QC)由所有样本的提取液等体积混合制备而成,QC的体积与样本相同。 B 生物学重复数 动物样本:6-8次以上生物学重复 菌体/菌液:6-8次以上生物学重复 临床样本:30次以上生物学重复,罕见病尽量多...
方法: 1. 样本处理:对样本进行提取、净化等预处理步骤,确保样本中代谢物的完整性。 2. 液质联用分析:采用高分辨质谱对样本进行扫描,通过数据库检索和模式识别,对代谢物进行鉴定和定量分析。 3. 数据处理:对得到的质谱数据进行去噪、归一化等处理,并建立代谢物数据库。 结果: 1. 大量样本的检测结果表明,该方法...
LC-MS非靶向代谢组学分析；● 研究结果 1.GC-MS和LC-MS分析幼虫的生物活性研究 通过GC-MS非靶向代谢组学和LC-MS非靶向代谢组学分析代谢物谱发现，如图1a所示，就发育持续时间而言，实验（Tr）组的9.59±0.27天显着长于对照组（CK）组的8.23±0.11天（P <0.01）。如图1b所示，就生存率而言，Tr组的...
上述三种方法的串联质谱(MS/MS)图数量、MS/MS图的质量以及前体离子与其对应的MS/MS谱之间的联系会影响它们在发现疾病生物标志物中的操作便捷性和性能。尽管代谢物数据库中MS/MS谱的数量已经大大增加,但代谢物鉴定仍然是LC-MS非靶向代谢组学中的一个...
代谢组学是继基因组学和蛋白组学之后发展起来的一门组学学科,非靶向代谢组学是无偏向性对所有小分子代谢物(相对质量小于1500)同时进行检测分析的代谢组学。 LC-MS是指液相色谱-质谱联用技术,该技术对待测组分的挥发性和热稳定性没有要求,不需要繁琐的衍生化步骤,样品前处理简单,检测温度低,分离物质快速、高效,是...
用非靶向代谢组检测来说,无论是使用GC-MS还是LC-MS/MS,了解其工作原理,对样品前处理,样品检测方式,数据分析等都会有很大的提升。质谱仪扫描模式的区别、两种检测方式检测的下机数据如何分析,差异代谢物筛选,都是代谢组检测和分析的重难点,看下表格具体了解差异: ...
图2. 血浆样本代谢组提取过程示例[3] ■Part 3:仪器检测 LC-MS检测仪器多种多样,小伙伴可以根据研究设计与实验条件自行选择。除了需要选择合适的仪器和方法外,还有两点要注意: 1. 样本检测顺序需随机打乱,检测前后需插入空白溶剂样本及 QC 样本,同时 QC 样本也需插入样本序列进行检测,用于柱平衡、质控、并辅助后...
方法二: 没有标准品,就只用面积相对定量。然后选用LC-MS/MS的SIM模式(样品杂质比较少,选择同位素丰度为100%的分子量,上下增减0.2)。考察因素导致的量的改变比较微量,选择一种物质为回收率指示物(反应液前处理前加入),一种物质为...
LC-MS灵敏度较高,能分离上千种小分子代谢物,检测限为ppb(即十亿分之一),可用于痕量分析。GC-MS 在代谢组学的研究中除了作为靶向性物质的分析,亦或作为LC-MS非靶向性代谢组学的热稳定化合物的一种补充。两者因为流动相和检测原理的差别,从而得到的数据也是有一定区别的。下面我们将从数据库、离子源、数据形式...
代谢组学方法可以同时测量多个终点，其可以揭示任何受影响的代谢途径。这种方法可以揭示农药与植物之间的相互作用。在此，作者使用非靶向代谢组学方法来研究TMX处理后的代谢扰动，目的是预测所涉及的酶以及TMX生物降解的机制。在我们之前的研究中，发现几乎TMX的所有代谢产物都被排泄到茶叶细胞的悬浮培养中。因此，我们分析...