此外,MIR516Ai显著降低了BECN1蛋白的降解速率。之后,作者采用免疫共沉淀(Co-IP)和质谱鉴定(LC-MS/MS)方法筛选了BECN1的互作蛋白,发现BECN1的互作蛋白中没有PHLPP2,但却包括E3泛素蛋白连接酶的几个核心成分CUL3、CUL4A和CUL4B,并显示出更高的肽谱匹配数(图5E)。据报道,CUL3和CUL4可以通过泛素化介导的蛋白酶...
质谱流式细胞技术(mass cytometry,MC)就是将电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)应用到单个细胞的分析,原理是用纯化的单元素同位素标记抗体,然后使用ICP-MS检测该元素离子峰。 该技术融合了流式细胞分选仪和ICP-MS。 蛋白质技术是我的技能黑洞,就做过简单的分析(MS结果的log2FC),甚至连相关的技术和概念都搞不清楚,该...
(LC-MS/MS)检测,鉴定出正常条件和 ERS 条件下 GRP94 的互作蛋白.运用生 物信息学在线软件对筛选的互作细胞蛋白进行 GO 富集,KEGG 信号通路注释和蛋白互作网络分析,并对其中的互作蛋白之 一波形蛋白(vimentin)进行免疫共沉淀验证.【结果】筛选到正常条件下与 GRP94 存在互作关系的蛋白 146 个,ERS 条件 下与 ...
与GST-CsBZIP40诱饵蛋白结合的蛋白复合物洗脱收集后进行SDS-PAGE凝胶电泳验证.将验证成功的样品洗脱液进行液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)检测,鉴定出未侵染和侵染状态下CsBZIP40的互作蛋白,将检测到的蛋白利用甜橙基因组数据库进行注释...
当SUNE1细胞稳定干扰LINC00173后,为其更换无血清培养基,16h后收集细胞培养上清液进行LC-MS/MS分析(图4A),在筛选到的10个差异蛋白(图4B)中,PA2G4和SDF4差异最大,并且在LINC00173敲除后显著下降(图4C)。之后,研究者分别对细胞裂解物和浓缩上清液中的RAB1B、PA2G4、SDF4蛋白进行了Western-blot检测,发现LIN...
随后作者根据自己的研究领域以及查询相关资料,在质谱筛选的特有互作蛋白中,选择了HSP90α蛋白进行后续的进一步验证和研究。 第五步,WB和qPCR验证 虽然现在的质谱仪灵敏度和准确度大幅度提高,但是也会出现假阳性的情况,因此,质谱结果还需要用其他手段进行交叉验证,使结果更加可靠。
将验证成功的 样品洗脱液进行液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)检测,鉴定出未侵染和侵染状态下 CsBZIP40 的互作蛋白,将检测 到的蛋白利用甜橙基因组数据库进行注释,筛选出在溃疡病菌侵染过程中与 CsBZIP40 特异结合的蛋白,并进行 GO,KEGG 和互作网络分析.【结果】过表达 CsBZIP40 的转基因植株表型正常,与对照植株无...
蛋白测序服务两种主要分析方法:Edman降解(Harvey和Ferrier,2011;Bauer等,1997)和质谱分析(MS)(Sahukar等,2016)。蛋白质测序和鉴定常用质谱法,Edman降解法是表征蛋白质N端重要的方法之一。 百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap FusionLumos质谱仪及岛津公司Edman降解测序系统对蛋白质序列进行分析,提供基于质谱的蛋...
定量蛋白组 修饰蛋白组 靶向蛋白组 蛋白定性 iTRAQ TMT abelfree DIA 磷酸化 乙酰化 L-WB(PRM技术) LC-MSMS 泛素化 糖基化 L-Elisa(PRM技术 互作蛋白鉴定 代谢组学服务 全谱代谢组 GC-MS靶向 LC-MS靶向 脂质组学 GC-MS全谱代谢 短链脂肪酸 胆汁酸/神经递质 脂肪酸 / 甘油脂 LC -MS全谱代谢 氨基酸/...
目的:采用UPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS(LC-MS)和分子对接方法,探讨白花蛇舌草注射液抗胃癌活性成分及作用机制.方法:通过LC-MS分析鉴定白花蛇舌草注射液的化学成分,运用GeneCards在线疾病数据库筛选胃癌相关疾病靶点,采用STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白-蛋白互作网络图(PPI)和拓扑学分析,采用分子对接技术验证白花蛇舌...