之后,作者采用免疫共沉淀(Co-IP)和质谱鉴定(LC-MS/MS)方法筛选了BECN1的互作蛋白,发现BECN1的互作蛋白中没有PHLPP2,但却包括E3泛素蛋白连接酶的几个核心成分CUL3、CUL4A和CUL4B,并显示出更高的肽谱匹配数(图5E)。据报道,CUL3和CUL4可以通过泛素化介导的蛋白酶体调节BECN1蛋白的稳定性和降解。因此作者检测了...
质谱流式细胞技术(mass cytometry,MC)就是将电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)应用到单个细胞的分析,原理是用纯化的单元素同位素标记抗体,然后使用ICP-MS检测该元素离子峰。 该技术融合了流式细胞分选仪和ICP-MS。 蛋白质技术是我的技能黑洞,就做过简单的分析(MS结果的log2FC),甚至连相关的技术和概念都搞不清楚,该...
(LC-MS/MS)检测,鉴定出正常条件和 ERS 条件下 GRP94 的互作蛋白.运用生 物信息学在线软件对筛选的互作细胞蛋白进行 GO 富集,KEGG 信号通路注释和蛋白互作网络分析,并对其中的互作蛋白之 一波形蛋白(vimentin)进行免疫共沉淀验证.【结果】筛选到正常条件下与 GRP94 存在互作关系的蛋白 146 个,ERS 条件 下与 ...
与GST-CsBZIP40诱饵蛋白结合的蛋白复合物洗脱收集后进行SDS-PAGE凝胶电泳验证.将验证成功的样品洗脱液进行液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)检测,鉴定出未侵染和侵染状态下CsBZIP40的互作蛋白,将检测到的蛋白利用甜橙基因组数据库进行注释...
为了研究LINC00173的作用机制,研究者用生物素标记的LINC00173正义或反义序列(0173 SS或AS)进行了RNA pull down和质谱检测(LC-MS/MS),寻找LINC00173的互作蛋白。pull down产物的SDS-PAGE银染结果显示有特异性蛋白条带,质谱也检测到了RAB1B蛋白(图3A)。RNA pull down WB实验验证并确定了LINC00173和RAB1B在NPC...
将验证成功的 样品洗脱液进行液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)检测,鉴定出未侵染和侵染状态下 CsBZIP40 的互作蛋白,将检测 到的蛋白利用甜橙基因组数据库进行注释,筛选出在溃疡病菌侵染过程中与 CsBZIP40 特异结合的蛋白,并进行 GO,KEGG 和互作网络分析.【结果】过表达 CsBZIP40 的转基因植株表型正常,与对照植株无...
随后作者根据自己的研究领域以及查询相关资料,在质谱筛选的特有互作蛋白中,选择了HSP90α蛋白进行后续的进一步验证和研究。 第五步,WB和qPCR验证 虽然现在的质谱仪灵敏度和准确度大幅度提高,但是也会出现假阳性的情况,因此,质谱结果还需要用其他手段进行交叉验证,使结果更加可靠。
泛素化 糖基化L-Elisa(PRM技术 互作蛋白鉴定 代谢组学服务 全谱代谢组GC-MS靶向LC-MS靶向脂质组学 GC-MS全谱代谢短链脂肪酸 胆汁酸/神经递质 脂肪酸/甘油脂 LC -MS全谱代谢氨基酸/糖类 胆固醇/植物激素甘油磷脂/鞘脂 嘌呤类物质…类黄酮/ TMAO …等八大类脂质 ...
重庆市农业科学院果树研究所的杨 蕾、洪林*、谭平*等基于LC-MS/MS技术测定‘塔罗科’血橙优系和对照品种果肉花青素代谢物的种类和含量,筛选两者的差异代谢物,为优系后续基础应用研究提供一定的理论依据。
目的:采用UPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS(LC-MS)和分子对接方法,探讨白花蛇舌草注射液抗胃癌活性成分及作用机制.方法:通过LC-MS分析鉴定白花蛇舌草注射液的化学成分,运用GeneCards在线疾病数据库筛选胃癌相关疾病靶点,采用STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白-蛋白互作网络图(PPI)和拓扑学分析,采用分子对接技术验证白花蛇舌...