(1)read_restart方法 找到tmp.restart.150文件后,重新写一个in文件,使用read_restart命令读入“断点文件”,设置继续运行的模拟代码即可。 read_restarttmp.restart.150neighbor0.4binneigh_modifyevery1delay1fix1allnvefix2alllangevin1.01.010.0904297timestep0.012run500000 注意: restart文件包含了units, atom_style, s...
这时候可以在驰豫代码后面使用write_restart命令,如: write_restartrestart.equil 4. read_restart命令:读取文件 重启模拟比较简单,使用方法和read_data命令类似: read_restartrestart.equil 需要注意的是,并不是所有的模拟信息都保存在restart.equil文件中。 比如fix命令就需要在新的模拟文件中重新设置,官方手册已经列举...
write_restart restart.equil 1. 4. read_restart命令:读取文件 重启模拟比较简单,使用方法和read_data命令类似: read_restart restart.equil 1. 需要注意的是,并不是所有的模拟信息都保存在restart.equil文件中。 比如fix命令就需要在新的模拟文件中重新设置,官方手册已经列举的很全面,有需要可以查查手册。 更多lam...
6.atom_style命令。定义在模拟中使用的原子类型。这决定了与原子相关联的属性。在通过read_data、 read_restart、 create_box 命令设置模拟之前,必须使用此命令。 语法 atom_style style args 举例 atom_style atomic atom_style bond atom_style full atom_style body nparticle 2 10 atom_style hybrid charge b...
lammps常用命令(2) 这一部分主要是大致思路以及全局设置 涉及命令:units、boundary、read_data、read_restart 一、in文件编写思路 大致in文件编写思路 二、对全局进行设置 1.单位的设置(units) 示例:units real 比较常用的单位有real、metal、lj等等,大家可以根据自己做的系统进行选择,至于每个命令的详细内容,大家可以...
重启动的原理很简单,就是写一个中间restart文件,在这个文件中记录某个状态的绝大部分信息,在重启动时,只需要读入这个文件,接着完成剩下的计算即可。restart文件是二进制文件。 restart命令 restart相关的命令有三个:restart, write_restart, read_restart。还有一个相关的脚本在lammps的tools目录下restart2data,可以用...
restart相关的命令有三个:restart, write_restart, read_restart。还有一个相关的脚本在lammps的tools目录下restart2data,可以用来将二进制的restart文件转换成可识别的文文文件,即data file文件,可以由read_data读入。 restart命令和write_restart命令是用来写重启动文件的,区别是前者用来周期性地将系统状态写入不同的res...
restart2data可以将restart的二进制文件转化为文本文件，可以由read_data读入。restart和write_restart不同...
lammps提供了restart、write_restart命令保存模拟文件、read_restart命令读取模拟文件,利用好这三个命令能够最大程度地避免因断电、死机等意外造成的影响。对于比较大的体系,驰豫时间也比较长,在模型驰豫之后保存restart文件,在后续的模拟过程中(比如不同应变速率的拉伸模拟),直接读取rstart文件进行拉伸即可,不需要再进行驰豫...
通过read_data或read_restart命令从data或restart文 件读入,这些文件可以包含分子拓扑结构信息,这 一方法在续算上也很有用。 按照晶格的方式创建原子,这种方式不包含 分子拓扑信息,可能会用到例如如下的一些命令: lattice, region, create_box, create_atoms。