这意味着,extra设置只会在第一次数据文件读取时生效,此后它们将不再影响系统。 4.add关键字的使用 多个数据文件的读取: 如果你使用add选项来向现有的模拟系统中添加原子(例如通过read_data命令添加新数据文件),在读取数据文件时,你需要确保数据文件的顺序和结构一致性。也就是说,如果你添加了新的原子或分子,extra...
基本格式:read_data file keyword args ...其中read_data是调用命令,file是文件名,如果还有需要追加的关键词和参数则在keyword中实现。 关于帮助文档中keyword分类: “keyword = add or offset or shift or extra/atom/types or extra/bond/types or extra/angle/types or extra/dihedral/types or extra/improper...
1. 确认LAMMPS是否支持读取多个data文件 LAMMPS支持通过多次使用read_data命令来读取多个data文件。这样可以在一个模拟中构建出由多个部分组成的复杂系统。 2. 查找LAMMPS官方文档中关于读取多个data文件的说明 在LAMMPS的官方文档中,read_data命令的语法和用法被详细描述。特别是,文档提到了可以通过使用add、offset、shift...
read_data Fe.data extra/atom/types 1 #第二次调用read_data命令,读取Cu.data,offset关键字说明原子类型+1 #shift设置读取Cu模型后,Cu原子尺寸整体沿-y方向偏移22埃米 read_data Cu.data add append offset 1 0 0 0 0 shift 0.0 -22 0.0 write_data Fe_Cu.data 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9...
十分感谢！！！我还有一个问题，就是多次读入data文件，atom_ID设置在哪里比较合适，我如果用add ...
我想在原有模拟基础上增加一些模拟的粒子，就准备使用read_data add append offset这组指令，可是不知道...
(1)水分子为tip4p类型水分子,在模拟中,使用fix addforce命令驱动水分子产生流动。 fixkickwataddforce${frc}0.00.0 1. (2)为防止石墨烯移动,使用以下命令保证石墨烯位置相对固定: fixmymumCarmomentum1linear111 fixmyrecCarrecenterNULLNULLINIT 1.
read_data NiCrCo.data(1) extra/atom/types 1 ##表示在Ni、Cr和Co原子的基础上增加C原子 ##轧辊原子模型的读取 read_data roller.data add append offset 1 0 0 0 0 shift 0.0 0.0 -134 ###定于原子质量 mass 1 58.69 # Ni mass 2 52 # Cr ...
然后,我们可以通过定义一个原子类型和键角类型,在输入文件中使用"read_data"命令来读取晶胞文件。在LAMMPS输入文件中,可以使用"pair_style"和"pair_coeff"命令定义键角的势函数和参数。 例如,我们可以将石墨烯晶胞文件命名为"graphene.data",在输入文件中添加以下命令来定义键角: ``` # Define the potential and...
read_data CPU = 0.794 seconds WARNING: Ignoring inactive control parameter: simulation_name (../...