在fix npt命令中,需要指定的关键参数包括: ID:fix命令的标识符,用于后续引用。 group-ID:要应用此fix命令的原子组。 temp:目标温度或温度范围。 Tstart/Tstop:温度变化的起始和结束值(如果需要的话)。 Tdamp:温度阻尼系数,控制温度调节的速度。 iso/aniso:压力控制模式。iso表示各向同性压力控制,即所有方向的压力...
aniso表示x、y、z三个方向根据各自方向的压力独立调节尺寸,压力大的方向尺寸变化大,三个方向尺寸变化可能会不相同。 下面以sio2非晶建模为例,对比iso和aniso不同控压方式的区别: iso控压: aniso控压: 通过对比,很明显的看出,在同一方向最终的结构尺寸是不同的。 在lammps模拟时,如果需要各方向尺寸维持一定的比例,...
iso,aniso和tri关键词只是等同于一起指定其他几个关键字的快捷方式。 关键词iso意味着三个对角线分量一起耦合来计算静水压强,并且膨胀/收缩作用在三个维度上同时作用,当使用“iso Pstart Pstop Pdamp”时等同于设定以下四个关键词(添注:更加简单的理解,此时压强在三个方向是各向同性的,意味着Pstart和Pstop在三...
这两个是所有fix命令都需要的。 style_name可以选择NVT、NPT或者NPH 关键词keyword和对应的数值value可以添加 AI检测代码解析 keyword = temp or iso or aniso or tri or x or y or z or xy or yz or xz or couple or tchain or pchain or mtk or tloop or ploop or nreset or drag or dilate or ...
LAMMPS中的系综(NPTNVT)命令 LAMMPS中的系综(NPTNVT)命令 语法:fix ID group-ID style_name keyword value ...ID 是fix名,group-ID是fix所作⽤的群组名。这两个是所有fix命令都需要的。style_name可以选择NVT、NPT或者NPH 关键词keyword和对应的数值value可以添加 keyword = temp or iso or aniso or ...
fix 2 all npt 1.0 1.0 1.0 aniso 0.0 0.0 NULL NULL NULL NULL 10.0 drag 1.0 thermo 1000 # 每1000 步输出一次结果 timestep 0.002 # 时间步长 0.002ps run 10000 #运行 10000 步 unfix2 fix 3 all nve fix 4 all temp/rescale 100 1.0 1.0 5 1.0 ...
温度的恒定与nvt一样,压强的恒 定通过调整体积来实现fix 1 all nvefix 2 all nvt temp 100 300 0.2 drag 1.0fix 3 all npt temp 300 100 0.2 iso 1.0 1.0 2 drag 1.0fix 4 all npt temp 300 100 0 24、.2 aniso 1.0 1.0 2 drag 1.0fix 5 all npt temp 200 500 0.2 x 1.0 1.0 2 y 1.0 ...
fix 2 all npt 1.0 1.0 1.0 aniso 0.0 0.0 NULL NULL NULL NULL 10.0 drag 1.0 thermo 1000 # 每1000 步输出一次结果 timestep 0.002 # 时间步长 0.002ps run 10000 #运行 10000 步 unfix2 fix 3 all nve fix 4 all temp/rescale 100 1.0 1.0 5 1.0 ...
如果三个方向都需要调节压力,可设置iso或aniso: fix1npttemp3003000.1iso001fix1npttemp3003000.1ansio001 这两个命令都是调节三个方向的压力,不同点在哪里? iso表示x、y、z三个方向压力耦合到一起,三个方向以相同的比例进行缩放。 aniso表示x、y、z三个方向根据各自方向的压力独立调节尺寸,压力大的方向尺寸变化大...
在该fix命令下npt和nph的控制器参数可以使用一个或一个以上,分别为iso,aniso,tri,x,y,z,xy,xz,yz和couple等关键词。 这些关键词可以用来特定控制外部应力张量的六个分量,或者耦合这些分量一起因此他们(应力分量)所代表的尺寸可以在一个恒压模拟中一起变化。