检查模型data文件吧,Inf是存在除0的情况,NaN是not a number,要么是数值超标重叠严重,要么是data为非数值文件。 使用delete_atoms overlap 0.1 all all删除重叠原子。 5. ERROR on proc 0: Non-numeric atom coords - simulation unstable 初始模型结构太差,原子重叠严重,导致部分数值超标 出现nan(往往也是上文错误...
3. 报错：未知标识符在数据文件中，常见原因是头数据和节数据不一致，检查数据文件，确保一致。4. 显示为nan的能量和温度，可能由于无效的物理或数值模拟计算。检查模型data文件，处理异常情况，如删除重复坐标。5. 原子坐标非数值，导致模拟不稳定，可能原因：初始模型结构问题，优化模型结构或调整邻居列表。
解决方法：检查 data 文件格式是否一致，确保头数据与节数据匹配。注意数据文件中不应存在无用的空行与注释行。错误4: -nan 解决方法：检查数据文件，Inf 通常由除零运算引起，NaN 则由非数字值或数值溢出导致。可尝试删除重叠原子，调整能量最小化精度，优化初始模型结构。错误5: Non-numeric atom coor...
初始模型结构太差,原子重叠严重,导致部分数值超标 出现nan 提高能量最小化的精度,重新能量最小化。可能无法进行能量最小化 可采用软力场pair_style soft 1.0nve:fix mobile all nve/limit 0.1同时调整 neighbor WARNING: Proc sub-domain size < neighbor skin, could lead to lost atoms 在运行fix nve后遇到这个...
如前几楼说的，构型不好，导致能量太大，超出了lammps所能记录的数字大小。
用排除法，先建立一个最简单的模型测试一下，看看是不是模型问题问题！发自小木虫Android客户端 ...
程序报错结果 Microsoft Windows [版本 10.0.19045.3086](c) Microsoft Corporation。保留所有权利。C:...
0 0 472478.96 0 472478.96 nan ERROR on proc 0: step 1: bondchk failed: i...
如果已经进行了最小化,但是后续驰豫仍然会报错,可查看log文件,排查minimize运行停止的条件,适当调小能量和力的容差或者加大迭代步数。 如以上语句可改为: min_stylecgminimize1.0e-151.0e-151000010000 mimimize可有效降低出错概率,谁用谁知道,用了都说好的一个命令。