lammps做分子动力学模拟时，需要一个输入文 件（input script），也就是in文件，以及关于体系的 原子坐标之类的信息的文件（data file）。lammps在 执行计算的时候，从这个in文件中读入命令，所以对LAMMPS的使用最主要的就是对in文件的编写和使 用。下面介绍一些关于in文件的事项 每一非空行都被认为是
1.1LAMMPSinputscript 我们用lammps做分子动力学模拟,需要一个输入文件.lammps在执行计算的时 候,从这个文本文件中逐行读入命令.大多数情况,lammps输入文件中各个命令的顺序并 不是很重要.但是你要注意以下几点: (1)lammps并不是将你的输入文件全部读入之后才开始进行计算的,或者说, ...
需求如下:我需要通过分子动力学 LAMMPS 软件模拟得到甲烷分子在常温常压下水中的溶解度,请你给出 in 文件内部建模命令得到模型的 data 文件,要求水分子使用 tip3p 模型,甲烷分子使用 opls-aa 模型,以及 create_box,molecule等建模命令。 它的思考过程如下: 它给出的in脚本如下: # LAMMPS Input Script for Methane...
脚本结构 一个LAMMPS输入脚本(input script)通常分四个部分: 初始化(Initialization) 设置在创建原子或从文件中读取原子之前需要定义的参数。 相关的命令:units, dimension, newton, processors, boundary, atom_style, atom_modify。 如果需要一些应力场参数,可能会用到命令:pair_style, bond_style, angle_style, ...
想要尝试在lammps的input script里面做循环, 结果因为一个小问题, 捣鼓了半天,给大家分享一下. #循环加载 label loopc variable i loop ${vCycle}fix 2 all deform 1 z erate ${e1} units box remap x run ${v2Tenstep}unfix 2fix 2 all deform 1 z erate ${e2} units box remap x run ${v2Ten...
1.1 LAMMPS input script 我们用lammps做分子动力学模拟, 需要一个输入文件. lammps在执行计算的时候, 从这个文本文件中逐行读入命令. 大多数情况, lammps输入文件中各个命令的顺序并不是很重要. 但是你要注意以下几点: (1) lammps并不是将你的输入文件全部读入之后才开始进行计算的, 或者说, 每条命令...
1、精品好资料学习推荐lammps做分子动力学模拟时,需要一个输入文件(input script),也就是in文件,以及关于体系的原子坐标之类的信息的文件(data file)。lammps在执行计算的时候,从这个in文件中读入命令,所以对LAMMPS的使用最主要的就是对in文件的编写和使用。下面介绍一些关于in文件的事项l 每一非空行都被认为是一条...
# LAMMPS Input Script units metal atom_style atomic lattice bcc 2.855 region box block 0 10 0 10 0 10 create_box 1 box create_atoms 1 box mass 1 55.845 pair_style eam pair_coeff * * Fe_mm.eam timestep 0.01 run 1000 1. 2. ...
lammps做分子动力学模拟时,需要一个输入文件(input script),也就是in文件,以及关于体系的原子坐标之类的信息的文件(data file)。lammps在执行计算的时候,从这个in文件中读入命令,所以对LAMMPS的使用最主要的就是对in文件的编写和使用。 下面介绍一些关于in文件的事项: 每一非空行都被认为是一条命令(大小写敏感,但...
# LAMMPS INPUT SCRIPT # Find minimum energy fcc configuration # Mark Tschopp # This requires the variable latconst to be input via the command line # e.g., lmp_win_no-mpi -var latconst 4 < calc_fcc_ver1.in ### # INITIALIZATION clear units metal dimension 3 boundary...