variablecloop5#设置循环控制变量variablethetaindex1020304050#设置疏水条带角度variablepequal40#设置壁面振动周期loglog.${theta}#输出不同疏水条带角度时的日志文件unitsljdimension3boundarypppneighbor0.3binneigh_modifyevery1delay0checkyesatom_stylemdpdregionmdpdblock-5050.436802-1530-1550unitsboxcreate_box3mdpdlatt...
之前使用改进的DPD方案进行的模拟采用传统DPD方案的边界条件,通过逆转穿过实体壁的重新插入粒子的速度来实现。在本研究中,提出了一种通过控制改进的DPD方案中的非中心耗散部分来施加无滑移或可调滑移边界条件的新方法。实体壁的建模方式使流体粒子感受到连续壁的存在,而不是传统壁模型中的几个离散冻结粒子。 修改的源代...
12-1 DPD模拟水,油,两性分子(模拟确认) 13-1金属体系一级相变-凝固、结晶、熔化(1-常用命令简单介绍)(1) 13-1金属体系一级相变-凝固、结晶、熔化(1-常用命令简单介绍)(2) 13-2金属体系一级相变-凝固、结晶、熔化(in 文件) 14-1 水在石墨烯表面行为 14-2 有机分子、气体在纳米孔道中的平衡和非平衡...
如果能有一个针对lammps的系列教程对学生掌握这个工具会大有裨益。本教程就是希望能够在学生使用lammps初期...
LAMMPS教程-学习指南.pdf,LAMMPS 教程王延颋 中国科学院理论物理研究所 中科院超算中心培训 北京 2012 年 9 月 17-18 日 1 2 1. 分子动力学模拟基本概念 3 1.1. 计算科学 ─ 理论与实验科学的桥梁 求解 模型参数 理论科学 计算科学 实验科学 模型框架 指导 计
粗粒化势:DPD, GayBerne, REsquared, colloidal, DLVO 介观势:granular, Peridynamics, SPH Bond potentials:harmonic, FENE, Morse, nonlinear, class 2, quartic (breakable) 45 Angle potentials:harmonic, CHARMM, cosine, cosine/squared, cosine/periodic, class 2 (COMPASS) Dihedral potentials:harmonic, ...
按照教程来编译如下：gunzip lamps.tar.gz tar xvf lamps.tar mv lammps-5Dec10 lmp cd lmp/src/...
LAMMPS手册-中文解析LAMMPS手册-中文版讲解LAMMPS手册-中文解析简介本部分大至介绍了LAMMPS的一些功能和缺陷。什么是LAMMPS?LAMMPS是一个经典的分子动力学代码,他可以模拟液体中的粒子,固体和汽体的系综。他可以采用不同的力场和边界条件来模拟全原子,聚合物,生物,金属,粒状和粗料化体系。LAMMPS可冗卵酶勘羚幌养魁父...
https://lammps.sandia.gov 主要功能: 支持多种粒子类型,可用于原子、聚合物分子、生物分子、金属、颗粒等类型系统的模拟。 支持多种力场,包括多种多体势函数。 支持三种可极化模型:QEq, core/shell model, Drude dipole model 支持多种粗粒化模型:DPD, GayBerne, REsquared, colloidal, DLVO ...
PKG_DIPOLE=on -D PKG_DPD-BASIC=on -D PKG_DPD-MESO=on -D PKG_DPD-REACT=on -D PKG_DPD-...