如: bond_coeff1harmonic392.80001.6150bond_coeff2fene30.01.51.01.0 (2)在data文件中设置 通过ms导出的data文件,自带cvff或pcff类型的势参数,可在此基础上直接修改。 第一步,同样需要在in文件中指定使用的bond势类型: bond_stylehybridharmonicfene 第二步,在data文件中每个bond的后面添加势类型,并填写对应的势...
potential所选的参数。每一种pair potential需要的pair_coeff不一样,比如lennard jones势,pair_coeff...
如计算水分子时的命令 bond_style harmonic bond_coeff 1 1000 0.9572 angle_style harmonic ...
参数找文献啊,tcl脚本给出的只是键的type,coefficient自己输入不就行了
原子之间有键连接,需要设置“bond_style"和“bond_coeff"。 如果模型是用ms建模、设置cvff或者pcff力场导出的data文件,可能会存在“bond_coeff"参数为0的情况,如下图所示: 以harmonic为例,bond力计算公式为: 参数为0,说明bond两端原子键力为0。 虽然两个原子在拓扑关系上有bond连接,但是此bond形同虚设,并不能起...
4. 混合势函数书写 书写混合势函数时,用pari_style hybrid 关键字,将要用到的势函数全部列出即可,然后再pair_coeff 中定义势函数。 某段势函数值相同时:pair_coeff: pair_coeff 9*10 9*10 XXXX 所有势函数值相同时:pair_coeff: pair_coeff * * XXX...
pair_style reax/c NULL pair_coeff * * 2019.ff.data n c C o C h H N fix 2 ...
bond_coeff2fene30.01.51.01.0 1. 2. (2)在data文件中设置 通过ms导出的data文件,自带cvff或pcff类型的势参数,可在此基础上直接修改。 第一步,同样需要在in文件中指定使用的bond势类型: bond_style hybrid harmonic fene 第二步,在data文件中每个bond的后面添加势类型,并填写对应的势参数。
bond_coeff 1 1589.92 1.397 bond_coeff 2 1589.92 1.397 bond_coeff 3 ...
不过瞄了一眼lammps,好像没有settle算法?那就是用的shake约束了。键常数1000,角常数100就足够了。发...