和fix nvt命令采用Nose/Hoover热浴进行时间积分不同的是,这个fix不进行时间积分,只是修改粒子所受的力。因此你必须要用一个另外的时间积分fix命令,譬如fix nve来迭代更新速度和原子的位置。如果这样的话,这个fix通常不应该与其他控温的fix命令一起使用,譬如fix nvt或者fix temp/scale命令。 在Howto thermostat页面进...
#fix 1 all nvt temp 0.5 0.5 0.1 fix 1 all npt temp 0.5 0.5 0.1 x 0.0 0...
在LAMMPS中,使用fix langevin命令进行动力学模拟时,需注意与时间积分命令(如fix nve)的配合使用,以确保速度和位置的迭代更新。同时,该命令不进行时间积分,因此不与控温命令(如fix nvt或fix temp/scale)同时使用。为了实现不同温度下的模拟,可以采用不同的计算方式和控温策略。具体而言,Tstart和T...
我理解的事langevin 研究体系的研究对象的时间尺度远长远溶液分子运动的时间尺度,可以理解为粒子在体系内...
fix 2 all nvt temp 0 100 0.055 取消nvt,改为nvt,让系统控制温度变化,从起始0K随着仿真进行(run)逐渐变化到100K(仿真结束时的温度),后面0.055是阻尼参数,推荐值是100倍步长,如果timestep设置为0.00055 ps(metal units),那阻尼系数可以给0.055,具体参考说明文档。以上方法为个人觉得...
和fix nvt命令采用Nose/Hoover热浴进行时间积分不同的是,这个fix不进行时间积分,只是修改粒子所受的力。因此你必须要用一个另外的时间积分fix命令,譬如fix nve来迭代更新速度和原子的位置。如果这样的话,这个fix通常不应该与其他控温的fix命令一起使用,譬如fix nvt或者fix temp/scale命令。
#unfix NVT #fix NVE all nve reset_timestep 0 variable pxy equal pxy variable pxz equal pxz ...
我用fix deform命令想加一个整体的xz平面的剪应力,但是总是说原子丢失,而我又看不到原子丢失,我的...