和fix nvt命令采用Nose/Hoover热浴进行时间积分不同的是,这个fix不进行时间积分,只是修改粒子所受的力。因此你必须要用一个另外的时间积分fix命令,譬如fix nve来迭代更新速度和原子的位置。如果这样的话,这个fix通常不应该与其他控温的fix命令一起使用,譬如fix nvt或者fix temp/scale命令。 在Howto thermostat页面进...
本文深入探讨了LAMMPS中的系综(fix langevin)命令在分子动力学模拟中的应用。首先,介绍该命令的原理和目的,即使用郎之万控热浴模拟原子与隐式溶剂的相互作用。与使用fix nve命令进行布朗动力学模拟相比,fix langevin命令通过添加摩擦阻力和溶剂原子碰撞力来实现更真实的动力学模拟。通过固定公式表达,原子...
【转】fix ave/spatial command (空间平均命令)limey@kyxk 2008-11-30 (这个命令是看到lammps论坛有...
thermo_temp表示lammps软件默认的包括温度动能项的计算命令的名字。在我看来,这个命令和NULL区别在于包括...
具体看menu里关于unit的解释http://lammps.sandia.gov/doc/units.html 作用范围的话应该是对group里的...
请问各位老师,我在使用lammps中的fix evaporate命令时,本来只准备删除部分水分子,但是用了这个命令之后...
fix langevinlammps.sandia.gov/doc/fix_langevin.html 补充部分在段落结尾以“添注”形式补充。 可以采用langevin/kk进行加速设置 语法: fix ID group-ID langevin Tstart Tstop damp seed keyword values ... ID 是fix名,group-ID是fix所作用的群组名。这两个是所有fix命令都需要的。
命令:fix id group-ID addforce fx fy fz keyword value 这个命令就是给指定的群组(粒子群组)施...
利用以下命令 (1) fix flow ave/spatial 1 100 1000 y 8 3.4 vx vy vz units box 发现并不是从8开始分层的,而是从9.7开始分的 层 坐标 原子数 1 -0.5 0 2 2.9 0 3 6.3 0 4 9.7 215.47 5 13.1 38 6 16.5 130.53 7 19.9 136.29 8 23.3 247.71 ...
#fix NVE all nve reset_timestep 0 variable pxy equal pxy variable pxz equal pxz variable pyz ...