Laceseq的原理可以简单地分为三个步骤:DNA条形码设计、文库构建和测序分析。 DNA条形码的设计是Laceseq的关键步骤之一。DNA条形码是一段特定的DNA序列,通过它可以将不同样品中的DNA片段区分开来。设计DNA条形码时需要考虑到其长度、碱基组成和碱基序列等因素,以确保其在文库构建和测序过程中的可靠性和准确性。 接下来,...
评估后发现LACE-seq可以敏感地捕获少量细胞中低表达的靶点,直接识别功能蛋白与RNA的相互作用。此外与几种基于CLIP的方法相比,LACE-seq在灵敏度、准确性、精密度和周期等方面均占优势。利用LACE-seq技术,可以在少量甚至单个的卵母细胞中识别Argonaute家族蛋白Ago2和Mili等的具体靶标。 LACE-seq方法原理图(图片引自文献...
本发明提供了一种在微量细胞中鉴定RNA结合蛋白靶位点的方法LACE-seq,LACE-seq方法的基本原理是对细胞进行紫外交联以固定蛋白质与RNA之间的相互作用,之后利用抗体特异性富集蛋白质与RNA的复合物,在对RNA进行3'末端接头连接后,便可进行反转录,当逆转录酶遇到RNA结合蛋白的交联位点后便会产生反转录终止产物,通过对反转录...
iUDI Plate LACEseq unique dual index Plate包含用于扩增indexed Illumina®兼容NGS文库的*双索引PCR引物。这些引物可用于需要TruSeq的LACEseq套件中™可共用的 索引引物。 iUDI Plate LACEseq包含索引PCR引物,并提供多达24对*的双索引,用于复用多达24个样本。索引的PCR引物预先分配在96孔PCR板中。每个双指数都有...