使用ggh4x，你可以使用scale_fill_multi()以自己的比例绘制多个值。它在stana包中的plotKEGGPathway包中使用，用于物种内多样性分析。函数的使用请参考ggh4x站点和代码。更多案例：noriakis.github.io/soft...Module 可以获取并解析Module信息。支持解析DEFINITION和REACTION。对于定义，该函数首先将定义分解为...
但却是存在参考基因组的情况#通过 AnnotationHub 包索引基因组,例如期望找绵羊(Ovis aries)的注释库library(AnnotationHub)hub <- AnnotationHub()query(hub, 'Ovis aries') #输入绵羊(Ovis aries)的名称进行匹配sheep <- hub[['AH72269']] #返回了数据库编号 AH72269...
但却是存在参考基因组的情况#通过 AnnotationHub 包索引基因组,例如期望找绵羊(Ovis aries)的注释库library(AnnotationHub)hub <- AnnotationHub()query(hub, 'Ovis aries') #输入绵羊(Ovis aries)的名称进行匹配sheep <- hub[['AH72269']] #返回了数据库编号 AH72269...
plotGOgraph(erich.go.BP) dev.off() 至此,GO分析就做完了 ---> over KEGG pathway介绍 KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes KEGG是日本主导的一个项目对gene和genome进行了非常详细的注释 KEGG网页分析里面有非常全的注释。 KEGG pathway 分析和上面介绍的GO分析是一样的只是把enrichGO()函数改成en...