想请教大家, KEGG的pathway图中, 实线/虚线/黑箭头/白箭头/T子线 都表示两种蛋白的什么关系? 是不是...
这一节画的图是比较新的,图中我用红色箭头标出的是pathway一级注释信息(big annotation,自己想的,非专有名词),纵轴花花绿绿的标注是pathway的二级注释(small annotation)。「如何获取注释」算一个难点,我上一讲也已经讲过:KEGG通路的从属/注释信息如何获取。整个图反映的是有多少基因落到了对应的分类里面。「辩证...
KEGG的数据 KEGG中的pathway是根据相关知识手绘的,这里的手绘的意思可能是指人工以特定的语言格式来确定通路各组件的联系;基因组信息主要是从NCBI等数据库中得到的,除了有完整的基因序列外,还有没完成的草图;另外 KEGG中有一个“专有名词”KO(KEGG Orthology),它是蛋白质(酶)的一个分类体系,序列高度相似,并且在同...
pathway 是根据相关知识手绘的 这里的手绘的意思可能是指人工以特定的 语言格式来确定通路各组件的联系 基因组信息主要是从 NCBI 等数据库中得到的 除了有 完整的基因序列外 还有没完成的草图 另外 KEGG 中有一个 专有名词 KO KEGG Orthology 它是蛋白质 酶 的一个分类体系 序列高度相似 并且在同一条通路上有...