首先需要访问KEGG的官网,获取其hsa编号,如PI3K-Akt signaling pathway对应hsa04151. 访问如下网址(更改对应物种、编号即可),这将返回该通路涉及的所有人类基因(hsaXXXXX)。KEGGhsa:XXXXX这个编号通常是NCBI Entrez Gene ID,即NCBI 基因数据库中的唯一基因编号。将网页内容复制到本地。再将Entrez Gene ID转化成基因名...
不过这里要按一定的格式(org:gene)输入要查找的目的基因,比如它给出的示例:syn表示物中,ssr3451表示基因ID,查找出来的基因名称是psbE。其实我试了一下,若直接检索基因名称(而不是KEGG中的基因ID)syn:psbE也是一样的。因为我不知道KEGG中基因ID如何编制的,但是,我同时也不知道基因的名称是如何定义的。比如果糖1...
下面就首先来讲一下KEGG orthology。任找一个代谢通路图，在上方有pathway meue | payhway entry | Show(Hide) description | 这3个选项，点击pathway entry, 出现了一个页面，这个随时被连接出来的页面相信大家一定再熟悉不过了。在这个页面中的pathway map项中点击按钮状的链接Ortholog table 。就进入了Ortholog...
KEGG的5种通路类型等基础知识这里不讲,不懂可去查。 如果要按物种进行拆库,则需要将上面的文件都按物种进行分类,使用是一样的。 KEGG数据库非常庞大,除了Pathway,genes等数据库外,还有很多其他的文件,比如: links目录,pathway与其他ID的对应关系 如pathway_ko.list ligand目录,即配体数据库,不做介绍。 按物种拆分...
小云：有筛选原则呀，那就是说有的解了，哈哈哈，师兄果然是最胖（棒）的，快快教教我呀，刚好也能...
国际分类 第10类-医疗器械 商标状态 商标注册申请 申请/注册号 33330426 申请日期 2018-09-05 申请人名称(中文) 美国女士科技有限公司;LADYTECHNOLOGIES,INC. 申请人名称(英文) - 申请人地址(中文) 美国特拉华州肯特郡多佛市新波顿路850号201房(邮编19904);850 New Burton Road, Suite 201, City of Dover, Cou...
K+num:基因ID号,表示在所有同源物种中具有相似结构或功能的一类同源蛋白 ko+num: 代谢通路名称,表示一个特定的生物路径 M+ num: 模块名称 C+ num: 化合物名称 E-,-,-,-: 酶名称 R + num : 反应名 RC+ num : 反映类型 RP+num: 反应物对 除了查看单个基因、代谢物的功能以外, 我们往往会拿到若干个...
如题，我想查询一个细菌表面是不是含有锰离子通道，胡摸乱撞的没有找对方向。怎么查找呢？？请求高手...
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结果一 题目 【题目】如果需要查询国际生物医学的文献信息,下列哪个数据库应该是第一选择A.EntrezB. PubMedC.OMIMD. HGMDE.KEGG 答案 【解析】B相关推荐 1【题目】如果需要查询国际生物医学的文献信息,下列哪个数据库应该是第一选择A.EntrezB. PubMedC.OMIMD. HGMDE.KEGG ...