今天就为大家介绍一种基因芯片BSA结合KASP单标记快速精细定位基因的方法。 01 基因芯片BSA初定位 BSA(Bulked Segregation Analysis)即集团分离分析法,一种利用分离群体中的极端单株组成的混池快速进行基因定位的方法。也是如今基因定位研究领域使用最多的一种方法。 利用双绿源基因芯片开展BSA基因定位,只需要两个亲本+两...
Kasp技术与传统SSR/STR分子标记技术比对 区别项目 kasp技术 SSR/STR技术 原理基础 DNA聚合酶扩增忠实性 不同碱基电泳速率差异性 技术难点 检测引物的设计 结果检测中的电泳操作 样本纯度要求 直扩或提纯 直扩或提纯 检测方法 终点荧光法 电泳法 灵敏度 能进行个位pg级数浓度的样本分型 一般要求百位pg级数浓度的样本浓...
在候选区段内,总共有9个被功能注释的基因,其中最有可能为候选基因的为一个编码LRR-RLK的Capana05g000704基因。 图2 KASP标记的基因分型结果 研究团队总共挑选了候选区段内的785个SNP用于开发KASP分子标记,成功设计了165对KASP标记引物,其中47对高质量的KASP标记引物用于测试,其中在抗/感材料之间显示有多态性的30个...
在KASP技术中,KASP标记引物是KASP技术实现的基石,引物设计的质量直接影响到KASP技术的可靠性和精确性。KASP标记引物设计的第一步是选择基因多态性区域,然后根据SNP的变异形态设计出标记的引物,建议在设计引物时选择6-8bp的标识,当然也可以用各种不同的杂合标识进行定量,进行多重PCR荧光,并发现不同的SNP类型。引物的长...
KASP的特点 在过去30 年中,分子标记从低通量限制性片段长度多态性(RFLP)开始,到最近达到的基于NGS 技术的SNP 标记,已经经历了三代。竞争性等位基因特异性PCR(kompetitive allele-specific PCR,KASP)是一种基于荧光的同质基因分型技术,最初由英国KBioscience 公司所开发,在2011 年被英国的LGC 公司收购。LGC公司开发...
KASP的原理与步骤 原理 步骤 (1)引物和探针设计 (2)普通PCR扩增 (3)荧光检测和分析 KASP与农业育种 KASP的特点 在过去30 年中,分子标记从低通量限制性片段长度多态性(RFLP)开始,到最近达到的基于NGS 技术的SNP 标记,已经经历了三代。竞争性等位基因特异性PCR(kompetitive allele-specific PCR,KASP)是一种基于...
高通量和易于自动化分析等特点而被广泛用于分子标记的开发和应用.竞争性等位基因特异性 PCR (kompetitive allele-specific PCR,KASP)技术是近些年来发展起来的一种主要基于 SNP 的高通量基因分型技术.该技术由于其高通 量,低成本和可操作性强等优点而在农作物性状改良等领域具有很大的应用潜力.本文介绍了 KASP 技术...
KASP的原理与步骤 原理 步骤 (1)引物和探针设计 (2)普通PCR扩增 (3)荧光检测和分析 KASP与农业育种 KASP的特点 在过去30 年中,分子标记从低通量限制性片段长度多态性(RFLP)开始,到最近达到的基于NGS...
【目的】 开发一系列高通量、低成本的桃重要性状竞争性等位基因特异PCR(Kompetitive Allele Specific PCR,KASP)标记,包括果皮有毛/无毛、果形扁平/圆形、果肉硬质/非硬质、DBF(Dominant Blood Flesh)红肉/非红肉、抗/感蚜等5对性状,加速桃优良品种培育,缩短桃育种年限。【方法】 本研究在控制这些性状的候选基因及...
本发明属于生物,具体涉及鉴定小麦粒重和粒宽的kasp分子标记及所用引物与应用。 背景技术: 1、小麦(triticum aestivum l.)是世界总产量第二的粮食作物,但随着人口增加、耕地面积减少和极端气候频现,影响小麦产量,威胁国家粮食安全,因此,发掘小麦产量潜力和培育高产优质小麦具有十分重要的战略意义。