1.打开Kaplan-Meier Plotter网站https://kmplot.com/analysis/ TP53是编码基因,因此我们应该选择mRNA。可以发现第一行是基于mRNA的基因芯片数据进行生存分析,但只有乳腺癌、卵巢癌、肺癌和胃癌可选;第二行是基于mRNA的RNA测序数据进行生存分析,其中乳腺癌和肝...
Kaplan-Meier Plotter Recent updates 2024.11.06.:A bug in the trichotomization process was corrected. 2024.11.01.:The "Restart" button in the custom plot page now returns to the previously uploaded data table. 2024.10.29.:The custom plot page now displays the time unit correctly in the plot...
Kaplan-Meier Plotter(http://kmplot.com/analysis/index.php?p=background)是常用的进行生存分析的网站,其数据来源于GEO、EGA、TCGA数据库,能够评估来自21种肿瘤的30000多个样本中所有基因的表达与患者生存率之间的相关性,从而发现和验证与生存相关的生物标志物。 下面就以探究基因TP53的表达与肝癌患者生存率的关系为...
What is the KM plotter? The KM plotter is capable to assess the effect of any gene or gene combination on survival inbreast, ovarian, lung, gastric, colon, prostate, GBM, LGG, melanoma, DLBCL, RCC, AML,and14 other tumor typesusingover 50,000 samplesmeasured using gene arrays, RNA-seq ...
Kaplan-Meier Plotter(http://kmplot.com/analysis/index.php?p=background)是常用的进行生存分析的网站,其数据来源于GEO、EGA、TCGA数据库,能够评估来自21种肿瘤的30000多个样本中所有基因的表达与患者生存率之间的相关性,从而发现和验证与生存相关的生物标志物。
“Affy id/Gene symbol”处输入基因的ID,Kaplan-meier plotter数据库识别70, 632个基因符号(包括HUGO基因命名委员会批准的官方基因符号、以前的符号和别名——所有这些都列在结果页面中)。由于不同的基因名称可能重叠,Kaplan-meier plotter数据库建议交叉检查所选基因的ID; ...
零基础学习生存分析，Kaplan-Meier Plotter数据库是适合初学者的工具，其数据来源广泛，能评估基因与患者生存率的相关性，用于发现生物标志物。接下来，我们将通过探究TP53基因在肝癌患者中的表达与生存率关系，演示如何使用Kaplan-Meier Plotter进行生存分析。首先，访问Kaplan-Meier Plotter网站（http://km...
Kaplan Meier plotter能够评估54k基因(mRNA,miRNA,蛋白质)对21种癌症类型(包括乳腺癌(n = 6,234),卵巢癌(n = 2,190),肺癌(n = 3,452)和胃癌)的存活率的影响 (n = 1,440)。Kaplan Meier plotter 数据库的来源包括GEO,EGA和TCGA。 该工具的主要目的是基于荟萃分析的生存生物标记物的发现和验证。
进入该网站的首页,可以看到强大的Kaplan Meier plotter网站,能够评估5.4万个基因在21种癌症类型中的作用,其中有4种癌症数据比较齐全,分别为乳腺癌、卵巢癌、肺癌和胃癌。 下面具体讲解怎样使用该数据库。 操作步骤: 点击start KM plot for breast cancer,进入乳腺癌生存分析界面。在这一页中,我们可以根据基因的名字或...
Our aim was to develop an online Kaplan-Meier plotter which can be used to assess the effect of the genes on breast cancer prognosis.