1.打开Kaplan-Meier Plotter网站https://kmplot.com/analysis/ TP53是编码基因,因此我们应该选择mRNA。可以发现第一行是基于mRNA的基因芯片数据进行生存分析,但只有乳腺癌、卵巢癌、肺癌和胃癌可选;第二行是基于mRNA的RNA测序数据进行生存分析,其中乳腺癌和肝...
The KM plotter is capable to assess the effect of any gene or gene combination on survival inbreast, ovarian, lung, gastric, colon, prostate, GBM, LGG, melanoma, DLBCL, RCC, AML,and14 other tumor typesusingover 50,000 samplesmeasured using gene arrays, RNA-seq or next generation sequencing...
The KM plotter is capable to assess the effect of any gene or gene combination on survival in breast, ovarian, lung, gastric, colon, prostate, GBM, LGG, melanoma, DLBCL, RCC, AML, and 14 other tumor types using over 50,000 samples measured using gene arrays, RNA-seq or next generation...
Kaplan-Meier Plotter(http://kmplot.com/analysis/index.php?p=background)是常用的进行生存分析的网站,其数据来源于GEO、EGA、TCGA数据库,能够评估来自21种肿瘤的30000多个样本中所有基因的表达与患者生存率之间的相关性,从而发现和验证与生存相关的生物标志物。 下面就以探究基因TP53的表达与肝癌患者生存率的关系为...
Kaplan-Meier Plotter(http://kmplot.com/analysis/index.php?p=background)是常用的进行生存分析的网站,其数据来源于GEO、EGA、TCGA数据库,能够评估来自21种肿瘤的30000多个样本中所有基因的表达与患者生存率之间的相关性,从而发现和验证与生存相关的生物标志物。
输入网址http://kmplot.com/analysis/,进入Kaplan-meimer Plotter数据库主页面。页面中央几个颜色的方块分别对应了mRNA,miRNA,protein以及DNA等四种分子的检索入口,其中mRNA分为gene chip数据以及RNA-seq数据。前者包括乳腺癌、卵巢癌、肺癌以及胃癌的数据;后者包括肝癌以及泛癌分析的数据。接下来以乳腺癌为例介绍数据库...
Kaplan-Meier Plotter数据库这是今天推荐首款生存曲线制作方法,官网(http://kmplot.com/analysis/),它是长的这个样子的。 乍一看,Kaplan-MeierPlotter数据库似乎只能研究6个癌种,小编之前也犯了同样的错误,“pan-cancer”(pancreatic cancer,胰腺癌像不像?)。其实,“pan-cancer”是画中有画,不信咱打开瞧瞧!
Our aim was to develop an online Kaplan-Meier plotter which can be used to assess the effect of the genes on breast cancer prognosis.
零基础学习生存分析，Kaplan-Meier Plotter数据库是适合初学者的工具，其数据来源广泛，能评估基因与患者生存率的相关性，用于发现生物标志物。接下来，我们将通过探究TP53基因在肝癌患者中的表达与生存率关系，演示如何使用Kaplan-Meier Plotter进行生存分析。首先，访问Kaplan-Meier Plotter网站（http://km...
Our aim was to develop an online Kaplan-Meier plotter which can be used to assess the effect of the genes on breast cancer prognosis.