为了研究EV71 RNA是否含有ac4C修饰,作者大规模纯化EV71 RNA,并通过UPLC-MS/MS进行定量,发现病毒粒子的EV71 RNA中ac4C残基占总胞苷的0.201%。此外,针对EV71基因组RNA进行acRIP-qPCR分析,发现来自病毒**细胞和病毒粒子的EV71 RNA都被拉下,而在体外转录的病毒基因组没有被拉下。为了绘制EV71基因组中的ac4C修饰谱,作者...
刘澎涛博士Nature:单细胞RNA-seq新成果 9月29日,在国际顶级学术期刊《Nature》发表的一项研究中,来自英国威康信托基金会桑格研究所、香港中文大学、上海农科院、上海交通大学、剑桥大学和墨尔本大学等处的研究人员,通过对骨髓(BM)先天淋巴细胞(ILCs)进行单细胞RNA测序(scRNAseq),确定了不同的ILC前体细胞亚群,描述了不...
在机制上,通过RNA pull down和RIP实验发现了HAAPIR直接与NAT10相互作用;通过RNA乙酰化测序/acRIP-seq结合RNA-seq筛选出受HAAPIR影响其乙酰化修饰和表达的靶基因TfecmRNA;通过细胞实验及ChIP-seq验证了TFEC可以进一步上调促凋亡因子Bik的积累,调控心肌细胞凋亡的进展。HAAPIR-NAT10-TFEC-BIK信号轴可能是减少缺血性心...
表观生物积极创新,在国际率先推出ac4C免疫共沉淀测序服务(acRIP-seq),全面解析ac4C在转录组的分布及变化,帮助科研人员深入理解RNA乙酰化在生命和疾病中的作用,促进疾病的精准诊断与治疗研究。 项目流程 RNA乙酰化免疫共沉淀 (acetylated RNA Immunoprecipitation,acRIP)基于抗体特异性结合乙酰化修饰的碱基的原理,以RNA免疫...
ac4C乙酰化RNA免疫沉淀测序(acRIP-seq) ac4C RNA乙酰化(N4-acetyicytidine,ac4C),N4位乙酰胞嘧啶,是真核原核生物中保守的化学修饰,早期研究认为ac4C主要存在于tRNA和18S rRNA上。近期研究显示,mRNA上也存在大量的ac4C,该修饰在促进蛋白翻译、影响RNA稳定性和可变剪接、调控基因表达发挥重要作用,是继m6A修饰之后表观...
Confirmation of the transctiptomic data (RNA-seq) by Quantitative Real-time PCR (Q-PCR.Olga A. PostnikovaMaria HultJonathan ShaoAndrea SkantarLev G. Nemchinov
punctipennismicroderadeserttranscriptomeilluminabeetle DenovotranscriptomeofthedesertbeetleMicroderapunctipennis(Coleoptera:Tenebrionidae)usingilluminaRNA-seqtechnologyXueyingLu•JieqiongLi•JianhuanYang•XiaoningLiu•JiMaReceived:12September2013/Accepted:15July2014/Publishedonline:21August2014ÓTheAuthor(s)2014...
优势四:独家提供ac4C一站式服务:ac4C整体水平检测、acRIP-seq、acRIP-qPCR验证、RIP和RNA pull down等。 优势五:率先研发超微量acRIP测序技术,RNA量低至500ng起。 优势六:国内最全的RNA修饰测序平台,提供m6A、m5C、m1A、m7G、m3C、m6Am、O8G、ac4C乙酰化和2'-O-甲基化测序。
acRIP-qPCR 云序提供acRIP-qPCR服务,可针对mRNA,lncRNA,环状RNA等不同类型的RNA分子进行检测,低通量验证靶基因RNA修饰水平。 05 机制互作研究 RIP-seq/qPCR 筛选或验证RNA修饰直接靶点,研究RNA修饰靶基因的调控机制。 RNA pull down -MS/WB 筛选或验证目标RNA互作基因或蛋白,研究相应的分子调控机制。
RNA乙酰化ac4C测序acRIP-seq N4-acetylcytidine (ac4C),N4位乙酰胞嘧啶,是真核原核生物中保守的化学修饰,早期研究认为ac4C主要存在tRNA和18S rRNA上[1]。而近期研究显示,mRNA上也存在大量的ac4C,该修饰在促进蛋白翻译,影响RNA稳定性和可变剪接,调控基因表达发挥重要作用,有望成为表观转录组学的新兴发展方向[2,3]...