从以上使用IP-MS的论文中可以发现，IP-MS的作用是筛选鉴定诱饵蛋白的相互作用蛋白，辅助选择关键互作蛋白；总的来说，针对想要研究的的蛋白，深入解析其蛋白互作的分子机制，是显著提高学术文章研究水准的重要内容。而IP-MS（Immunoprecipitation-Mass Spectrometry）就是目前发现和揭示蛋白互作的主流技术方案。Co-IP 1、...
而IP-MS(Immunoprecipitation-Mass Spectrometry)就是目前发现和揭示PPIs/PTMs的主流技术方案。 一、IP-MS的原理 IP-MS即免疫沉淀-质谱联用技术,是一种基于质谱技术的分析方法,通过用特定抗体捕获目的蛋白,然后用质谱仪对免疫沉淀后的复合物进行高通量分析,从而获得蛋白质的定量和定性信息。 其原理是通过亲和纯化的方...
IP用于从复杂的生物样本中分离和纯化特定蛋白质，依赖于抗体对目标蛋白的特异性识别并形成抗原-抗体复合物，然后通过物理方法（如离心或磁珠）将这些复合物沉淀下来，再结合Western blot（WB）或质谱（mass spectrum，MS）对目标蛋白进行检测分析，即可对目标蛋白进行定性/定量分析。接下来，我们从IP实验目的、IP实验原理...
IP-MS实验最主要的失败原因是前期的IP实验效果不理想,导致互作蛋白鉴定过多或过少、后续无法成功验证。而用WB检验IP实验效果,常因为抗体质量差、WB与质谱原理和灵敏度有差异等原因,导致WB结果难以预示MS结果。IP效果评估能在质谱检测前评估IP实验效果,提高后续IP-MS成功率,缩短试错周期。 我们推出“IP效果评估”产品...
一次IP-MS实验，能高通量的鉴定和筛选到多个与目的蛋白存在相互作用的蛋白质，是确认目的蛋白与预期靶蛋白的特异性相互作用的首选方法。百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Q ExactiveHF质谱平台，结合Nano-LC色谱，提供高效快速的IP-MS互作蛋白分析服务技术包裹，您只需要将您的实验目的告诉我们并将您的细胞寄给我们，...
IP-MS实验中的IP对照组为阴性对照,主要目的是为了在分析结果中过滤掉实验组鉴定到的非特异性结合蛋白。质谱仪检测灵敏度非常高,在实验组IP样品中,超过90%的蛋白鉴定结果可能都来自于非特异性结合蛋白或未清洗干净背景残留;但基于目前蛋白相互作用中大部分属于较弱的、瞬时相互作用这一认识,通常也不建议通过较剧烈的...
因此，在进行IP-MS实验前，需要对抗体进行充分的验证，确保其能够特异性地捕获目标蛋白质。其次，需优化IP和质谱条件，以提高捕获效率和减少非特异性结合。在进行IP时，需要优化洗涤条件，以去除非特异性结合的蛋白质，从而提高目标蛋白质的纯度。在进行质谱分析时，需选择合适的质谱仪和分析方法，以获得准确的蛋白质...
筛选和发现目的蛋白(target)在细胞中新的互作蛋白或者新的后修饰,免疫沉淀(IP,Immunoprecipitation)结合LC-MS(液相色谱-质谱连用,蛋白质组学研究的核心工具)是目前的主流技术方案(IP-MS)。通过一次IP-MS实验,能高通量的鉴定和筛选到多个与要研究的目的蛋白(target)存在相互作用的蛋白质(蛋白质复合物组分),从而拥有...
具体来说,IP-MS实验会先用一种特殊的方法,把我们要研究的东西变成很小很小的粒子,就像把一个大蛋糕切成好多好多小块一样。然后,这些小粒子会被送到一个像小隧道一样的地方,在那里,它们会受到一些特殊的“力量”的影响。有的粒子会被吸到这边,有的会被吸到那边,就像小朋友们玩磁铁,有的东西会被磁铁吸住,有...
因此在目前的IP-MS数据分析中,主要以蛋白的非标记定量信号强度(LFQ intensity)作为蛋白定量数据,比较实验组与对照组间蛋白定量差异,与常规定量蛋白质组学数据分析方法类似,只是通常选择更高的差异蛋白筛选阈值。 3、数据预处理 质谱检测获得的原始谱图数据经过搜库软件的解析可获得各个样品中蛋白的相对定量信息。基于目...