1.打开imageJ,open➡️选择需要分析的图片,导入; 2. Plugins➡️IHC Toolbox; 3.选择右上角矩形框➡️框选组织切片中典型的代表,面积不要太小也不要太大,不然软件会卡死(´△`)➡️点击 training 进行分析; 4.忘记截图:完成上一步之后,会出现一个条带,将拉动条带按钮,调到合适位置; 5.点
首先,你需要下载 ImageJ 软件,并安装好。然后,下载 IHC-Toolbox 插件,并将其放入 ImageJ 的安装目录下的 plugins 文件夹中。下载链接:### 开始分析 1. 在菜单栏中选择“文件”→“打开”,打开你的实验数据图片(这里使用的是网络图片,大家可以用自己的数据)。然后在“plugins”菜单下选择“IHC Toolbox”,打开...
将下载好的IHC_Toolbox.jar拖放到“ImageJ”窗口或使用Plugins ->Install命令下载并安装。 ImageJ 窗口 使用说明 对于颜色检测,半自动颜色选择和自动统计颜色检测模型的功能组合在一起。颜色选择用于在消除背景色像素(设置为 255)时选择和保留正色像素。然后,根据这些保留的正彩色像素的直方图创建统计颜色模型。 自动...
插件下载网址在这里:https://imagej.nih.gov/ij/plugins/ihc-toolbox/index.html 点击IHC_Toolbox.jar便可以下载了,下载之后不要解压,直接放在ImageJ安装目录中“Plugins”这个文件夹当中即可。或者打开ImageJ,直接将下载好的IHC Toolbox拖拽到窗口亦可。 ...
打开图片:在Fiji中导入待分析的Masson染色图片。颜色分离:利用“Color Deconvolution”功能分离颜色,得到清晰的胶原纤维和肌纤维图像。测量面积:测量胶原面积与组织总面积,计算胶原容积分数。利用IHC Toolbox插件:功能扩展:IHC Toolbox插件提供了细胞计数、腺体检测等更多功能,适用于多种科研需求。颜色选取...
IHC_Toolbox下载地址在本文末尾,无需在后台回复内容下载。 ::: IHC 插件详情 我们使用适用于不同类型IHC图像分析的半自动方案开发了该工具箱。它可以检测IHC图像中的基本成分,并且对于研究人员进行进一步分析非常有用。用户创建的模型和参数可以保存并传输给不同的用户,以便在不同的实验室中重现检测结果。该工具中包...
高效分析步骤 1. 打开图片 2. 使用“Color Deconvolution”分离颜色 3. 测量胶原面积与组织总面积 计算胶原容积分数为:胶原面积 / 组织总面积 * 100%,精确至百分比。扩展:IHC Toolbox IHC Toolbox插件提供更多功能,包括细胞计数、腺体检测等。下载插件,使用矩形选框选取颜色,进行分析操作。其他高效...
IHC Toolbox 插件的下载链接:https://imagej.nih.gov/ij/plugins/ihc-toolbox/index.html。 安装方法: 打开待分析图片,使用矩形选框选中感兴趣的颜色(例如蓝色): Plugins -> IHC Toolbox,点击Traing: 此外,IHC Toolbox下Nuclei还可以进行细胞计数,例如下图计算DAB阳性的细胞数为392: ...
处理步骤:使用RGB Stack或IHC Toolbox插件将苏木素和DAB颜色分离,然后选择DAB着色区域进行平均光密度值(MOD)或累计光密度值(IOD)分析。 结果解读:根据分析结果了解阳性信号的强弱和分布情况,从而判断目标蛋白的表达水平。 这些示例展示了ImageJ在不同领域的应用和结果解读方法,希望能够帮助你更好地理解和使用ImageJ。
如果RGB Stack不能很好地分离蓝色的苏木素和棕色的DAB,则可以尝试ImageJ的内置插件IHC Toolbox(没有的可以去官网下载Immunohistochemistry(IHC) Image Analysis Toolbox),用以剔除苏木素的颜色,教程如下: 最下面这张图就只剩下DAB着色的区域了,分离效果相当满意 如果阳性信号只有深浅之分,无分布面积之分,则选择平均...