在ImageJ中使用IHC Profiler插件进行免疫组化分析,可以按照以下步骤进行: 1. 安装ImageJ和IHC Profiler插件 下载ImageJ: ImageJ1的下载链接:ImageJ1下载 建议使用ImageJ1,因为Fiji与IHC Profiler可能存在不兼容的情况。 安装IHC Profiler插件: 下载IHC Profiler插件压缩包(包含插件
1、利用IHC Profiler插件对样本的染色情况进行自动化评分; 2、利用Trainable Weka Segmentation插件分别对阳性细胞和阴性细胞进行计数; 一、IHC Profiler-自动分析染色情况 IHC Profiler,将阳性细胞的平均灰度值(染色强度)和阳性面积百分比(染色面积)共同作为 IHC 测量指标[2],最终给出四种评分:High positive (3+), Po...
免疫组织化学(Immunohistochemistry,IHC)是利用抗原与抗体特异性结合的原理,通过化学反应使标记抗体的显色剂显色来确定组织细胞内抗原(多肽和蛋白质),对组织切片或细胞标本中的某些多肽和蛋白质等大分子物质进行原位定性、定位或定量研究的实验技术。 IHC定量研究中免疫组化图片该如何分析?今天就使用ImageJ软件给大家分享...
2️⃣ File——Open,选择胞浆着色的图片 3️⃣ 点击Plugins——IHC Profiler 4️⃣ 确认是否为胞浆着色,可选择核着色 5️⃣ 选择H DAB,点击OK📊 评分结果如图所示,可进行赋分分析。今天刚摸索了基本步骤,许多功能还有待探索,之后会总结IHC免疫组化的方法步骤以及图片分析的意义。 长图 0 0 发表...
IHC Profiler的使用步骤包括：通过Image -> Color -> Color Deconvolution 分离想要测量的Channel，选中Channel，运行Macro，即可得到四种评分所占面积的百分比。Trainable Weka Segmentation插件用于自动阳性细胞计数，其原理基于机器学习算法。打开图片和插件（Plugins -> Trainable Weka Segmentation），选择细胞质...
IHC Profiler插件可以在/projects/ihcprofiler/免费获取。其次这款插件如何安装到自己的Imagj软件中？1、解压下载好的IHC_Profiler.zip文件，得到两个文件：IHC Profiler文件和IHC_Profiler.txt宏文件。2、复制这两个文件粘贴至Plugins文件夹中：My Computer > C: > Program Files > ImageJ > plugins 此外复制IHC_...
先前分享的10步填上免疫组织化学(IHC)的坑的文章中介绍了使用IHC Profiler插件对免疫组化结果进行打分,有兴趣可以点这里。今天给大家分享另一种免疫组化图片分析方法,分享之前先介绍两个概念: 1 什么是灰度值(Gray value)? 灰就是不够黑,介于黑白之间...
就笔者自身的使用习惯而言,我更青睐于后者。这两个插件都需要java语言环境,这也是很多教程没有明说的一点。IHCProfiler应用时,对图片的质量要求更高,而且它输出的结果不是细胞数目,而是阳性等级判读,结果并不精确。就冲着可以自主训练模型这一点,IHCToolbox它...
先前分享的10步填上免疫组织化学(IHC)的坑的文章中介绍了使用IHC Profiler插件对免疫组化结果进行打分,有兴趣可以点这里。今天给大家分享另一种免疫组化图片分析方法,分享之前先介绍两个概念: 1 什么是灰度值(Gray value)? 灰就是不够黑,介于黑白之间。用于显示的灰度图像通常用每个采样像素8 bit的非线性尺度来保...
免疫组织化学(Immunohistochemistry,IHC)是利用抗原与抗体特异性结合的原理,通过化学反应使标记抗体的显色剂显色来确定组织细胞内抗原(多肽和蛋白质),对组织切片或细胞标本中的某些多肽和蛋白质等大分子物质进行原位定性、定位或定量研究的实验技术。 IHC定量研究中免疫组化图片该如何分析?今天就使用ImageJ软件给大家分享...