Mean即为平均荧光强度。(Mean即Mean gray value,等于IntDen/Area),IntDen=Integrated Density(荧光强度总和) 可以将结果复制到Excel或者直接导出生成csv文件(Results窗口-File-Save as) 这样我们就得出了图片的平均荧光强度,但需要注意的是:免疫荧光是半定量分析,平均荧光强度只能半定量地表征特异性蛋白的表达。 主要是...
选择合适的阈值以区分信号和背景,推荐使用默认阈值以减少误差。尝试不同的阈值算法,如Auto Threshold,选择最符合要求的。接着,设置测量参数,确保勾选Mean gray value和Limit to threshold,以限制测量范围。点击Measure,你将得到Mean,即平均荧光强度,等于IntDen(荧光强度总和)除以Area。这项数据可用于...
让我们通过一个激光共聚焦显微镜下的荧光图像来实践。首先,打开图像并选择单通道(Image-Color-Split Channels),如果是RGB格式,记得进行通道分离。对于高精度的16-bit或32-bit图像,可以直接进行阈值调整,但要保留尽可能多的信号信息,避免损失。接着,使用Image-Adjust-Threshold设定阈值,选择默认值以...
步骤1:细胞分割与ROI Manager应用1. 从上篇教程中,学习细胞计数的方法,分割出细胞核并使用ROI Manager管理选区。2. 将每个细胞的轮廓添加到ROI Manager,便于后续测量。步骤2:简单快捷的测量方法更新后的建议是,在Set Measurements时,选择Redirect to原始图像,这样在Analyze Particles时,测量将基于原...
我以ImageJ自带的样本(File-Open Samples-Fluorescent Cells)为例,具体操作如下: 1、打开图片后,用直线/矩形工具框选感兴趣区域 注意左上角,这时候其实是红色这一通道。 2、打开Plot Profile(Analyze-Plot Profile) 这是红色通道荧光强度(灰度)沿着矩形的分布,然后点击live。
这样在Analyze Particles的时候,就只会根据ROI去测原图的荧光强度,而不是二值化后的图。 一、细胞自动计数 还是以自动计数的那种图为例: 1、打开该图像(File -> Open,或者将图片直接拖动到菜单栏) 2、将图像转为8-bit(Image -> Type -> 8-bit) ...