因为不规则细胞进行Watershed的效果不好,所以需要首先找出细胞轮廓(Find Maxima),确定细胞的大致位置区域,即找出了细胞之间的界限。 然后通过Image Calculator对图片进行相减操作,可利用细胞之间的界限,将粘连的细胞分割开来,最终进行Analyze Particles,进行细胞计数和测量。 具体操作参考: 另一种分割细胞的方式,是使用cellpo...
One more thing,文献中关于伪彩的配色通常会将红绿色,替代为品红色(magenta)和青色(cyan),以增强色盲对图片的识别。 在ImageJ中,可以将红色和绿色通道分别提取出来,然后以magenta和cyan样式的伪彩Merge channel: 或者通过(Image -> Color -> Replace Red with Magenta)一键替换: 如果对于ImageJ使用有什么问题可以...
通过File->Open Samples打开示例图片Leaf,然后使用Image->Show Info查看图片信息想,信息如下: ImageJ1.54g;Java1.8.0_345[64-bit];Windows1010.0;71MBof24300MB(<1%)Title:leaf.jpgWidth:507pixelsHeight:446pixelsSize:883KPixel size:1x1pixel^2ID:-4Bits per pixel:32(RGB)NothresholdScaleToFit:falseUncalibr...
ImageJ是一个基于java的公共的图像处理软件,它是由National Institutes of Health开发的。可运行于Microsoft Windows,Mac OS,Mac OS X,Linux,和Sharp Zaurus等多种平台。其基于java的特点,使得它编写的程序能以applet等方式分发。软件简介 ImageJ是一个基于java的公共的图像处理软件,它是由National Institutes of...
ImageJ功能全览🔍 在生物实验的图片处理中,ImageJ是一个不可或缺的软件。它简洁易用,功能丰富,能够计数细胞、定量多种信号。以下是ImageJ中一些常用的功能介绍:📂 图片类型转换:可以将图片转换为不同的格式,如TIFF、PNG等。🔍 亮度/对比度调整:通过调整图片的亮度和对比度,可以优化图片的显示效果。
使用ImageJ软件测量图像中的长度、面积等信息时,需要先设置图像的比例尺,比例尺用于将图像中的像素单位转换为真实的世界单位。 加载图像# 启动ImageJ程序,从File菜单选择Open Samples,选择Leaf打开树叶的示例图像: 设置比例尺# 将图片适当放大,使用直线工具沿着图片中的直尺刻度绘制一条直线,作为标尺参考线。绘制的时候...
ImageJ的教程如Seurat一般丰富,ImageJ实用教程汇总中安装讲到了插件开发,可以说比官网教程还要用心了。 图像数据是空间表达数据的重要组成部分之一,好在我们在图像数据分析中已经积累了一些算法与工具。具体来看ImageJ可以做哪些工作: 荧光照片的合并、分割 比例尺的批量添加 ...
ImageJ系列最新教程 ImageJ(官网:https://imagej.nih.gov/ij/)是由美国National Institutes of Health(NIH)开发的免费开源的公共图像处理软件,在生物及医学图像分析中起着非常重要的作用。 在我们以往的分享中我们已经给大家分享了使用ImageJ分析荧光共定位、细胞计数、免疫...
本吧热帖: 1-ImageJ阈值问题求教 2-咨询贴,,, 3-imagej 免费送 win mac都有 需要的朋友自取 4-求助,请问imagej能测算毫米级别的颗粒数量直径吗? 5-请教一个问题 6-请问右键点击直线工具没反应是为什么 7-如下地质相关 8-imageJ测心率问题请教! 9-求问为啥watershed以
《如何用ImageJ进行细胞计数? 》 案例2:长度、面积测量 ImageJ当然也可用来测定长度和不规则区域的面积,比如分析叶片面积,病斑面积、划痕实验的划痕面积等,方法其实和计数几乎一样。 参考教程: 《如何用ImageJ测量图片不规则区域面积?》 案例3:荧光照片合并 ...