这样我们就得出了图片的平均荧光强度,但需要注意的是:免疫荧光是半定量分析,平均荧光强度只能半定量地表征特异性蛋白的表达。 主要是因为免疫荧光实验中的人为因素太多,例如拍照时的曝光、焦距等等,而且非特异性结合的因素也不能完全消除。所以我们在拍照的时候,以及处理数据的时候,一定要有一个固定的标准和流程,从而减...
2、打开MorphoLibJ(Plugins -> MorphoLibJ -> Segmentation -> Morphological Segmentation) 出现插件界面,Input Image选择Border Image: 点击Run,获得默认参数下的分割结果: 这里会发现有细胞存在过分割现象,提高Tolerance可以避免该情况: 点击Create Image得到分割结果: 然后通过Wand tool分别选中两个细胞,然后通过Edit ->...
能量曲线方便易用,直观快速但不够量化,要更量化地进行径向荧光强度分析,需要用到ImageJ或者说FIJI(JIFI是更新版的ImageJ).首先打开荧光图片,使用直线工具画线,注意画线对比时长度数据要一致。转换为8bit图像 我们这个荧光图是单色荧光,因此我们这里先将其转化成8bit格式,减少其他通道信号可能带来的问题,在菜...
1️⃣ 多通道拆分:首先,打开你的图像,选择“Image”菜单,然后选择“Color”选项,点击“Split Channels”来拆分多通道图像。2️⃣ 阈值选择:接下来,选择“Image”菜单,点击“Adjust”选项,然后选择“Threshold”来设置阈值。3️⃣ 阈值算法选择:在“Threshold”对话框中,你可以选择不同的阈值算法,比如“Auto...
免疫荧光数据经常会需要统计目标信号相应的数据,比如某个细胞质的平均荧光强度,总荧光强度,面积等。那这个时候我们就可以用我们的科研神器imagej进行统计分析。一起来看一下吧。多通道拆分:Image——Color——Split Channels阈值选择:Image——Adjust——Threshold阈值
使用Image -> Adjust -> Brightness/Contrast菜单来调整图像的亮度和对比度。 如果背景荧光较强,你可以使用Image -> Adjust -> Threshold菜单来设置阈值,从而去除背景信号。在阈值设置窗口中,你可以手动调整阈值或使用自动阈值方法。 4. 使用ImageJ的测量工具分析荧光强度 在调整完图像参数后,你需要设...
Fiji ImageJ 第6讲——基于荧光强度的共定位分析 tangji0318 3.3万 18 01:35 ImageJ拆分与合并RGB颜色通道 Perry_Yang 6700 0 02:29 Imagej多通道拆分,合并,颜色更换 瑞瑞大大呀 2.1万 1 1:17:47 【实验技术】最实用的Image J使用教程上线,一起学起来~ 益加医8 3.3万 10 ...
🔍想要用ImageJ分析荧光强度?跟着这个教程,轻松上手!1️⃣ 首先,打开你的荧光图片。2️⃣ 接着,在ImageJ中选择“Image”菜单,点击“Type”,然后选择“RGB Stack”。确保你的图片位于最左侧。3️⃣ 调整荧光强度,可以使用“Adjust”菜单下的“Threshold”工具。选择同一范围、大小和放大倍数一致的图片进...
ImageJ是一个很强大的图片处理工具,那么对于我们平时拍的带有荧光色彩的图片,想要测量荧光的强度用来进行定量描述,这些都可以用ImageJ来进行完成,如下图所示,我们可以对其进行荧光强度测定。 软件 FIJI 图文教程 1. 这里我们使用软件内置的图片进行教程的素材,选择荧光细胞的图片进行接下来的分析。
我以ImageJ自带的样本(File-Open Samples-Fluorescent Cells)为例,具体操作如下: 1、打开图片后,用直线/矩形工具框选感兴趣区域 注意左上角,这时候其实是红色这一通道。 2、打开Plot Profile(Analyze-Plot Profile) 这是红色通道荧光强度(灰度)沿着矩形的分布,然后点击live。