26B (single flow cell)c 52B (dual flow cells)c,e Max read length2 × 300 bp2 × 250 bp2 × 150 bp Key applications and methodsf Large whole-genome sequencing (human, plant, animal) checkmark checkmark Small whole-genome sequencing ...
Illumina公司 和Bio-Rad实验室公司 在JP摩根健康大会上发布了Illumina® Bio-Rad® Single-Cell Sequencing Solution。该综合解决方案是单细胞分析的第一个新一代测序(NGS)工作流程,使研究人员能够在组织功能、病情进展和治疗反应方面深入探查个体细胞的协同作用。 Illumina公司 (纳斯达克股票代码:ILMN) 和Bio-Rad实验...
Flow Cell binding Regin:与flowcell表面引物互补序列,对应图中的P5、P7 Index:识别不同样本,从而使得多样本可以在一个flowcell中同时测序 Sequencing binding site:边合成边测序时的引物结合序列,图中的Rd1 SP和Rd2 SP(sequencing primer)是为了双端测序而设计 进一步纯化文库,去除多余的接头和未发生连接的DNA片段 ...
参考文献: 1.Wang Y, Navin Nicholas E. 2015. Advances and Applications of Single-Cell Sequencing Technologies. Molecular Cell 58:598-609 2.Chi KR. 2014. Singled out for sequencing. Nat Meth 11:13-7 3.Huang L, Ma F, Chapman A, Lu S, Xie XS. 2015. Single-Cell Whole-Genome Amplificat...
[5] A. Bankevich, S. Nurk, D. Antipov, et al., SPAdes: a new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing, J. Comput. Biol. 19 (2012) 455–477. [6] A.D. Prjibelski, I. Vasilinetc, A. Bankevich, et al., ExSPAnder: a universal repeat resolver fo...
1)FollowCell 接头差异 Paired End Paired End Uracil Specific Excision Reagent (USER) 尿嘧啶切割位点 FormamidopyrimidineGlycosylase (fpg) 糖基化酶切割位点 Single Read Single Read Periodate Linearization 高碘酸盐切割位点 a)双端测序 Paired-End sequencing(PE/双端测序) ...
2019年,华大基因的研究团队在Genome Biology上发表了题为“Comparativeanalysis of sequencing technologies for single-cell transcriptomics”的研究论文。该研究针对单细胞转录组比较BGISEQ-500和 Illumina HiSeq平台,研究结果显示两个平台在基因表达定量方面具有相当的灵敏度和准确性,技术变异性较低。
前面介绍的都是paired-end的测序,而single-end测序方式是只将index,sequencing primer binding site以及P7/P5添加到 fragamented DNA片段的一端,另一端直接连上P5/P7,将片段固定在Flowcell上桥式PCR生成DNA簇,然后单端测序读取序列 illumina的官方视频:
Flowcell是用于高通量基因测序的流体芯片,可以将DNA或者RNA分子加载到泳道上,固定在其表面,并通过流动液体在其表面进行进行扩增和信号采集。 Flow cell结构 Flow cell介绍 Flowcell(流动池/芯片)上包括8条泳道,称为lane流通槽 lane:lane是测序反应发生的平行泳道,是试剂添加、洗脱等过程的发生位置。每条lane首末两端...
前面介绍的都是paired-end的测序,而single-end测序方式是只将index,sequencing primer binding site以及P7/P5添加到 fragamented DNA片段的一端,另一端直接连上P5/P7,将片段固定在Flowcell上桥式PCR生成DNA簇,然后单端测序读取序列 最后给出illumina的官方视频...