1. 数据集预处理:利用ImageGP平台将表S3中Sox2、Nanog、Klf4、Esrrb、H3K27ac、Med1、H3K4me1及其结合基因数据转换成两列格式,如表S4所示(https://www.bic.ac.cn/BIC,图S7,步骤1)。2. 选择数据输入类型:选择两列矩阵格式输入数据。
1. 数据集预处理:利用ImageGP平台将表S3中Sox2、Nanog、Klf4、Esrrb、H3K27ac、Med1、H3K4me1及其结合基因数据转换成两列格式,如表S4所示(https://www.bic.ac.cn/BIC,图S7,步骤1)。 2. 选择数据输入类型:选择两列矩阵格式输入数据。 3. 数据输入:以两列格式粘贴转录调控因子和靶向基因数据,第一列是靶向基...
1. 数据集预处理:利用ImageGP平台将表S3中Sox2、Nanog、Klf4、Esrrb、H3K27ac、Med1、H3K4me1及其结合基因数据转换成两列格式,如表S4所示(https://www.bic.ac.cn/BIC,图S7,步骤1)。 2. 选择数据输入类型:选择两列矩阵格式输入数据。 3. 数据输入:以两列格式粘贴转录调控因子和靶向基因数据,第一列是靶向基...
"Genome-wide identification of inter-individually variable DNA methylation sites improves the efficacy of epigenetic association studies" NPJ Genom Med. 2017. 2:11 编辑于 2020-12-18 18:14 内容所属专栏 生信分析数据库 最强生信数据库合集 订阅专栏...
收集拟南芥激素基因和469个物种的基因组数据 从文献和TAIR数据库(https://www.arabidopsis.org/index.jsp)中人工筛选了所有拟南芥激素相关的基因。首先,使用“AUX”、“ABA”、“plant hormone”、“phytohormone”、“Arabidopsis”和“phytohormone pathway”等关键词在PubMed、Web of Science和Google Scholar上进行了...
这些ChIP-seq数据源自Whyte等人的研究 (表S3)。UpSet图的生成接受两种输入格式:两列矩阵和二进制矩阵格式。生成ChIP-seq UpSet图的步骤如下: 1. 数据集预处理:利用ImageGP平台将表S3中Sox2、Nanog、Klf4、Esrrb、H3K27ac、Med1、H3K4me1及其结合基因数据转换成两列格式,如表S4所示(https://www.bic.ac.cn/BIC...
2022年2月正式创刊发行!发行后相继被Google Scholar、ESCI、PubMed、DOAJ、Scopus等数据库收录!2024年6月获得首个影响因子23.7,位列全球SCI期刊前千分之五(107/21848),微生物学科2/161,仅低于Nature Reviews,同学科研究类期刊全球第一,中国大陆11/514!
收集拟南芥激素基因和469个物种的基因组数据 从文献和TAIR数据库(https://www.arabidopsis.org/index.jsp)中人工筛选了所有拟南芥激素相关的基因。首先,使用“AUX”、“ABA”、“plant hormone”、“phytohormone”、“Arabidopsis”和“phytohormone pathway”等关键词在PubMed、Web of Science和Google Scholar上进行了全...
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2.T. Hachiya et al. "Genome-wide identification of inter-individually variable DNA methylation sites improves the efficacy of epigenetic association studies" NPJ Genom Med. 2017. 2:11