安装HTseq: pip install HTseq 从STARsolo得到的bam file缺少index,需要先: samtools index SRR11050949Aligned.sortedByCoord.out.bam 然后跑HTseq: htseq-count -f bam -r name -i gene_id -s yes -t gene -…
htseq又运行一遍,-s参数设置为no: htseq参数设置 /mnt/d/AAA-台式机-LY-WorkSpace/aligned$ htseq-count -f bam -s no 105TRA_sorted-2.bam gencode.v31.annotation.gff3 > 105TRA-2-s-no.count 结果生成105TRA-2-s-no.count文件:
#!/bin/bash #这里写了一个小脚本,把三个步骤写在一个for循环里,for循环会依次对每一个sam文件进行处理 for i in `seq 77 80` do samtools view -S /media/yanfang/FYWD/RNA_seq/sam_files/SRR9576${i}.sam -b > /media/yanfang/FYWD/RNA_seq/bam_files/SRR9576${i}.bam #第一步将比对后的...
冯改英目前担任河南云瑞子牛医疗器械有限公司法定代表人,同时担任河南云瑞子牛医疗器械有限公司执行董事兼总经理;二、冯改英投资情况:冯改英目前是河南云瑞子牛医疗器械有限公司直接控股股东,持股比例为100%;目前冯改英投资河南云瑞子牛医疗器械有限公司最终收益股份为100%;三、冯改英的商业合作伙伴:基于公开数据展示,冯...
Henrysguardingangel 2019-5-10 00:47 新技能解锁躺在床上用电动牙刷刷牙时间没那么慢 û收藏 转发 评论 ñ赞 评论 o p 同时转发到我的微博 按热度 按时间 正在加载,请稍候...相关推荐 e刷新 +关注 市民朱小雨 12月24日 16:51 小雨吃小鸡炖蘑菇,鲜美多汁,配上汤圆,...
2021年4月8日 Y-60D/100D/150D定位型压力表 1、仪表主体为Ф100各型压力表,内部设定位装置组成定位压力表。如耐酸定位压力表Y-100B-D、定位微压表YE-100-D、定位耐震压力表YN-100-D等。 2、定位压... 柳州富达机械有限公司 布料中100D和150D是什么意思? -...
如果你再给我一分钟 我会抱紧你永不放手 哪怕是耗尽我的所有 也要给你美好的以后 如果你再给我一分钟 我会抱紧你永不放手 哪怕是最后为我停留 我也能感觉到你的温柔 如果你再给我一分钟 我会抱紧你永不放手 哪怕是最后为我停留 我也能感觉到你的温柔 真心就足够 00:00 00:00 查看...
滕晓明透露,目前,中华医学会生殖分会的专家委员会正在着手进行研究、讨论,随着高龄女性怀孕需求的增加,是否需要界定一个年龄底线。在上海一妇婴辅助生殖中心的实验室里,一个个液氮罐里,存放着珍贵的冷冻胚胎。 中青报客户端 中国青年报·中青在线记者 王烨捷 视频 周冠伶 来源:中国青年报 ( 2017年08月15日 07 ...