hTFtarget收录了659个转录因子的chip-seq实验样本和699个转录因子的高可信度DNA结合序列，是目前最全面的人类转录因子数据库。进入官网：https://guolab.wchscu.cn/hTFtarget/#!/，网站分为TF、Target、Peak、Co-regularion、Co-association和Prediction六个模块。小编将依次介绍各个模块的功能和使用方法。TF 有确定的目...
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hTFtarget整合了699个转录因子的高可信度DNA结合序列,其中包含699个TF的2737个TFBS基序。hTFtarget采用指数衰减的BETA模型量化转录因子对靶基因的调控能力,并结合ROADMAP表观修饰状态来准确预测这些转录因子的潜在靶基因。而且hTFtarget应用了两种不同的策略来检测TF-target信心,包括ChIP-Seq数据分析和转录因子结合位点(TFBS)...
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hTFtarget收录了699个转录因子的详细信息，包括2737个TFBS序列，并使用BETA模型量化调控能力。它结合ROADMAP表观修饰状态，通过ChIP-Seq分析和TFBS扫描确保预测的准确性。该数据库由中国华中科技大学郭安源教授团队开发和维护，功能丰富，包括浏览TF靶基因、探索TF调控、查询ChIP-Seq样本、分析TF协同调控等，方便...
hTFtarget: 一个全面的人类转录因子靶基因数据库 要点介绍 研究问题: 人类转录因子靶基因的鉴定及其数据库的构建和应用 研究方法: 整合大规模的人类转录因子靶基因数据,综合考虑转录因子结合位点及基因组表观修饰状态对转录因子DE、GEO和SRA数据库中659个转录因子的7190个ChIP-seq数据集、TRANSFAC、JASPAR、HOCOMOCO 的69...
hTFtarget一个全面的人类转录因子靶基因数据库.docx,hTFtarget: 一个全面的人类转录因子靶基因数据库 要点介绍 研究问题: 人类转录因子靶基因的鉴定及其数据库的构建和应用 研究方法: 整合大规模的人类转录因子靶基因数据,综合考虑转录因子结合位点及基因组表观修饰状态
数据资源 hTFtarget整合来自ENCODE、GEO和SRA数据库中659个转录因子的7190个ChIP-seq数据集、TRANSFAC、JASPAR、HOCOMOCO 的699个转录因子的高可信度DNA结合序列,采用指数衰减的BETA模型量化转录因子对靶基因的调控能力,并结合ROADMAP表观修饰状态来准确预测这些转录因子的潜在靶基因(图1A)。hTFtarget使用了ChIP-seq分析和转...
hTFtarget整合了699个转录因子的高可信度DNA结合序列,其中包含699个TF的2737个TFBS基序。hTFtarget采用指数衰减的BETA模型量化转录因子对靶基因的调控能力,并结合ROADMAP表观修饰状态来准确预测这些转录因子的潜在靶基因。而且hTFtarget应用了两种不同的策略来检测TF-target信心,包括ChIP-Seq数据分析和转录因子结合位点(TFBS)...